Protein–RNA interactions for Protein: Q494R4

CCDC153, Coiled-coil domain-containing protein 153, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC153Q494R4 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC153Q494R4 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC153Q494R4 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC153Q494R4 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC153Q494R4 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC153Q494R4 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC153Q494R4 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC153Q494R4 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC153Q494R4 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC153Q494R4 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC153Q494R4 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC153Q494R4 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC153Q494R4 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC153Q494R4 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC153Q494R4 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC153Q494R4 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC153Q494R4 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC153Q494R4 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC153Q494R4 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC153Q494R4 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC153Q494R4 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC153Q494R4 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC153Q494R4 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC153Q494R4 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC153Q494R4 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC153Q494R4 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC153Q494R4 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC153Q494R4 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC153Q494R4 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC153Q494R4 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC153Q494R4 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC153Q494R4 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC153Q494R4 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC153Q494R4 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC153Q494R4 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC153Q494R4 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC153Q494R4 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC153Q494R4 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC153Q494R4 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC153Q494R4 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC153Q494R4 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC153Q494R4 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC153Q494R4 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC153Q494R4 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC153Q494R4 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC153Q494R4 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC153Q494R4 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC153Q494R4 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC153Q494R4 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC153Q494R4 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC153Q494R4 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC153Q494R4 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC153Q494R4 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC153Q494R4 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC153Q494R4 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC153Q494R4 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC153Q494R4 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC153Q494R4 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC153Q494R4 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC153Q494R4 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC153Q494R4 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC153Q494R4 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC153Q494R4 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC153Q494R4 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC153Q494R4 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC153Q494R4 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC153Q494R4 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CCDC153Q494R4 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC153Q494R4 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC153Q494R4 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC153Q494R4 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC153Q494R4 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC153Q494R4 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC153Q494R4 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC153Q494R4 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC153Q494R4 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC153Q494R4 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC153Q494R4 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC153Q494R4 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC153Q494R4 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC153Q494R4 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC153Q494R4 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC153Q494R4 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC153Q494R4 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC153Q494R4 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC153Q494R4 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC153Q494R4 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC153Q494R4 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC153Q494R4 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC153Q494R4 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC153Q494R4 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC153Q494R4 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC153Q494R4 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC153Q494R4 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC153Q494R4 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC153Q494R4 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC153Q494R4 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC153Q494R4 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC153Q494R4 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC153Q494R4 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms