Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZCT1

ZNF260, Zinc finger protein 260, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF260Q3ZCT1 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.74
ZNF260Q3ZCT1 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ZNF260Q3ZCT1 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ZNF260Q3ZCT1 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ZNF260Q3ZCT1 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ZNF260Q3ZCT1 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ZNF260Q3ZCT1 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ZNF260Q3ZCT1 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ZNF260Q3ZCT1 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ZNF260Q3ZCT1 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ZNF260Q3ZCT1 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ZNF260Q3ZCT1 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ZNF260Q3ZCT1 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ZNF260Q3ZCT1 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ZNF260Q3ZCT1 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
ZNF260Q3ZCT1 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ZNF260Q3ZCT1 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ZNF260Q3ZCT1 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ZNF260Q3ZCT1 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ZNF260Q3ZCT1 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ZNF260Q3ZCT1 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ZNF260Q3ZCT1 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ZNF260Q3ZCT1 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ZNF260Q3ZCT1 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ZNF260Q3ZCT1 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
ZNF260Q3ZCT1 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ZNF260Q3ZCT1 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ZNF260Q3ZCT1 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ZNF260Q3ZCT1 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ZNF260Q3ZCT1 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ZNF260Q3ZCT1 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ZNF260Q3ZCT1 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ZNF260Q3ZCT1 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ZNF260Q3ZCT1 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ZNF260Q3ZCT1 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ZNF260Q3ZCT1 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ZNF260Q3ZCT1 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ZNF260Q3ZCT1 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ZNF260Q3ZCT1 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ZNF260Q3ZCT1 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ZNF260Q3ZCT1 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ZNF260Q3ZCT1 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ZNF260Q3ZCT1 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ZNF260Q3ZCT1 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ZNF260Q3ZCT1 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ZNF260Q3ZCT1 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ZNF260Q3ZCT1 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
ZNF260Q3ZCT1 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ZNF260Q3ZCT1 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ZNF260Q3ZCT1 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ZNF260Q3ZCT1 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ZNF260Q3ZCT1 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ZNF260Q3ZCT1 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZNF260Q3ZCT1 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZNF260Q3ZCT1 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZNF260Q3ZCT1 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZNF260Q3ZCT1 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
ZNF260Q3ZCT1 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZNF260Q3ZCT1 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZNF260Q3ZCT1 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZNF260Q3ZCT1 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZNF260Q3ZCT1 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZNF260Q3ZCT1 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZNF260Q3ZCT1 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZNF260Q3ZCT1 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZNF260Q3ZCT1 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ZNF260Q3ZCT1 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ZNF260Q3ZCT1 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
ZNF260Q3ZCT1 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
ZNF260Q3ZCT1 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ZNF260Q3ZCT1 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ZNF260Q3ZCT1 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZNF260Q3ZCT1 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZNF260Q3ZCT1 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZNF260Q3ZCT1 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZNF260Q3ZCT1 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZNF260Q3ZCT1 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZNF260Q3ZCT1 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZNF260Q3ZCT1 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZNF260Q3ZCT1 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZNF260Q3ZCT1 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZNF260Q3ZCT1 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
ZNF260Q3ZCT1 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZNF260Q3ZCT1 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZNF260Q3ZCT1 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZNF260Q3ZCT1 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZNF260Q3ZCT1 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZNF260Q3ZCT1 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZNF260Q3ZCT1 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZNF260Q3ZCT1 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZNF260Q3ZCT1 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZNF260Q3ZCT1 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
ZNF260Q3ZCT1 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZNF260Q3ZCT1 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZNF260Q3ZCT1 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZNF260Q3ZCT1 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZNF260Q3ZCT1 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZNF260Q3ZCT1 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZNF260Q3ZCT1 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ZNF260Q3ZCT1 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.9 ms