Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXZ7

TTLL9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL9Q3SXZ7 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TTLL9Q3SXZ7 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TTLL9Q3SXZ7 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TTLL9Q3SXZ7 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TTLL9Q3SXZ7 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TTLL9Q3SXZ7 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TTLL9Q3SXZ7 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TTLL9Q3SXZ7 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TTLL9Q3SXZ7 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TTLL9Q3SXZ7 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TTLL9Q3SXZ7 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TTLL9Q3SXZ7 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TTLL9Q3SXZ7 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TTLL9Q3SXZ7 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TTLL9Q3SXZ7 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TTLL9Q3SXZ7 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TTLL9Q3SXZ7 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TTLL9Q3SXZ7 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TTLL9Q3SXZ7 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TTLL9Q3SXZ7 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TTLL9Q3SXZ7 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TTLL9Q3SXZ7 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TTLL9Q3SXZ7 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TTLL9Q3SXZ7 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TTLL9Q3SXZ7 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TTLL9Q3SXZ7 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TTLL9Q3SXZ7 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TTLL9Q3SXZ7 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TTLL9Q3SXZ7 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TTLL9Q3SXZ7 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TTLL9Q3SXZ7 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TTLL9Q3SXZ7 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TTLL9Q3SXZ7 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TTLL9Q3SXZ7 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TTLL9Q3SXZ7 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TTLL9Q3SXZ7 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TTLL9Q3SXZ7 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TTLL9Q3SXZ7 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TTLL9Q3SXZ7 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TTLL9Q3SXZ7 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TTLL9Q3SXZ7 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TTLL9Q3SXZ7 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TTLL9Q3SXZ7 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TTLL9Q3SXZ7 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TTLL9Q3SXZ7 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TTLL9Q3SXZ7 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TTLL9Q3SXZ7 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TTLL9Q3SXZ7 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TTLL9Q3SXZ7 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TTLL9Q3SXZ7 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TTLL9Q3SXZ7 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TTLL9Q3SXZ7 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TTLL9Q3SXZ7 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TTLL9Q3SXZ7 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TTLL9Q3SXZ7 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TTLL9Q3SXZ7 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TTLL9Q3SXZ7 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TTLL9Q3SXZ7 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TTLL9Q3SXZ7 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TTLL9Q3SXZ7 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TTLL9Q3SXZ7 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TTLL9Q3SXZ7 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TTLL9Q3SXZ7 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TTLL9Q3SXZ7 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TTLL9Q3SXZ7 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TTLL9Q3SXZ7 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TTLL9Q3SXZ7 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TTLL9Q3SXZ7 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TTLL9Q3SXZ7 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TTLL9Q3SXZ7 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TTLL9Q3SXZ7 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TTLL9Q3SXZ7 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TTLL9Q3SXZ7 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TTLL9Q3SXZ7 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TTLL9Q3SXZ7 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TTLL9Q3SXZ7 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTLL9Q3SXZ7 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTLL9Q3SXZ7 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TTLL9Q3SXZ7 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTLL9Q3SXZ7 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTLL9Q3SXZ7 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTLL9Q3SXZ7 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTLL9Q3SXZ7 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TTLL9Q3SXZ7 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TTLL9Q3SXZ7 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TTLL9Q3SXZ7 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TTLL9Q3SXZ7 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TTLL9Q3SXZ7 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TTLL9Q3SXZ7 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TTLL9Q3SXZ7 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TTLL9Q3SXZ7 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TTLL9Q3SXZ7 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TTLL9Q3SXZ7 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TTLL9Q3SXZ7 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TTLL9Q3SXZ7 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TTLL9Q3SXZ7 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TTLL9Q3SXZ7 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TTLL9Q3SXZ7 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TTLL9Q3SXZ7 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TTLL9Q3SXZ7 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms