Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI83

KRTAP24-1, Keratin-associated protein 24-1, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP24-1Q3LI83 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
KRTAP24-1Q3LI83 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KRTAP24-1Q3LI83 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KRTAP24-1Q3LI83 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KRTAP24-1Q3LI83 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KRTAP24-1Q3LI83 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KRTAP24-1Q3LI83 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KRTAP24-1Q3LI83 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KRTAP24-1Q3LI83 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KRTAP24-1Q3LI83 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KRTAP24-1Q3LI83 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KRTAP24-1Q3LI83 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KRTAP24-1Q3LI83 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KRTAP24-1Q3LI83 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KRTAP24-1Q3LI83 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KRTAP24-1Q3LI83 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KRTAP24-1Q3LI83 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KRTAP24-1Q3LI83 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
KRTAP24-1Q3LI83 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KRTAP24-1Q3LI83 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KRTAP24-1Q3LI83 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KRTAP24-1Q3LI83 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KRTAP24-1Q3LI83 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KRTAP24-1Q3LI83 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KRTAP24-1Q3LI83 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KRTAP24-1Q3LI83 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KRTAP24-1Q3LI83 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KRTAP24-1Q3LI83 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KRTAP24-1Q3LI83 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KRTAP24-1Q3LI83 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
KRTAP24-1Q3LI83 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KRTAP24-1Q3LI83 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KRTAP24-1Q3LI83 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KRTAP24-1Q3LI83 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KRTAP24-1Q3LI83 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KRTAP24-1Q3LI83 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KRTAP24-1Q3LI83 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KRTAP24-1Q3LI83 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KRTAP24-1Q3LI83 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KRTAP24-1Q3LI83 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KRTAP24-1Q3LI83 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KRTAP24-1Q3LI83 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KRTAP24-1Q3LI83 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KRTAP24-1Q3LI83 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KRTAP24-1Q3LI83 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
KRTAP24-1Q3LI83 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KRTAP24-1Q3LI83 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KRTAP24-1Q3LI83 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KRTAP24-1Q3LI83 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KRTAP24-1Q3LI83 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KRTAP24-1Q3LI83 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KRTAP24-1Q3LI83 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KRTAP24-1Q3LI83 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KRTAP24-1Q3LI83 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KRTAP24-1Q3LI83 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KRTAP24-1Q3LI83 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
KRTAP24-1Q3LI83 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KRTAP24-1Q3LI83 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KRTAP24-1Q3LI83 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KRTAP24-1Q3LI83 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
KRTAP24-1Q3LI83 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KRTAP24-1Q3LI83 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KRTAP24-1Q3LI83 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KRTAP24-1Q3LI83 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KRTAP24-1Q3LI83 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KRTAP24-1Q3LI83 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KRTAP24-1Q3LI83 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KRTAP24-1Q3LI83 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
KRTAP24-1Q3LI83 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KRTAP24-1Q3LI83 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KRTAP24-1Q3LI83 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
KRTAP24-1Q3LI83 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
KRTAP24-1Q3LI83 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
KRTAP24-1Q3LI83 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
KRTAP24-1Q3LI83 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KRTAP24-1Q3LI83 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KRTAP24-1Q3LI83 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KRTAP24-1Q3LI83 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KRTAP24-1Q3LI83 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KRTAP24-1Q3LI83 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KRTAP24-1Q3LI83 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KRTAP24-1Q3LI83 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KRTAP24-1Q3LI83 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KRTAP24-1Q3LI83 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KRTAP24-1Q3LI83 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KRTAP24-1Q3LI83 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KRTAP24-1Q3LI83 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KRTAP24-1Q3LI83 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KRTAP24-1Q3LI83 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KRTAP24-1Q3LI83 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KRTAP24-1Q3LI83 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KRTAP24-1Q3LI83 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
KRTAP24-1Q3LI83 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KRTAP24-1Q3LI83 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KRTAP24-1Q3LI83 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KRTAP24-1Q3LI83 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KRTAP24-1Q3LI83 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KRTAP24-1Q3LI83 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRTAP24-1Q3LI83 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
KRTAP24-1Q3LI83 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms