Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI59

KRTAP21-2, Keratin-associated protein 21-2, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-2Q3LI59 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
KRTAP21-2Q3LI59 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
KRTAP21-2Q3LI59 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
KRTAP21-2Q3LI59 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC4.56□□□□□ -1.68
KRTAP21-2Q3LI59 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
KRTAP21-2Q3LI59 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
KRTAP21-2Q3LI59 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
KRTAP21-2Q3LI59 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
KRTAP21-2Q3LI59 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
KRTAP21-2Q3LI59 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
KRTAP21-2Q3LI59 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
KRTAP21-2Q3LI59 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
KRTAP21-2Q3LI59 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
KRTAP21-2Q3LI59 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
KRTAP21-2Q3LI59 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC4.56□□□□□ -1.68
KRTAP21-2Q3LI59 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
KRTAP21-2Q3LI59 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
KRTAP21-2Q3LI59 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
KRTAP21-2Q3LI59 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
KRTAP21-2Q3LI59 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
KRTAP21-2Q3LI59 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
KRTAP21-2Q3LI59 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
KRTAP21-2Q3LI59 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
KRTAP21-2Q3LI59 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
KRTAP21-2Q3LI59 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
KRTAP21-2Q3LI59 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
KRTAP21-2Q3LI59 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
KRTAP21-2Q3LI59 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
KRTAP21-2Q3LI59 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
KRTAP21-2Q3LI59 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
KRTAP21-2Q3LI59 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
KRTAP21-2Q3LI59 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
KRTAP21-2Q3LI59 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
KRTAP21-2Q3LI59 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
KRTAP21-2Q3LI59 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
KRTAP21-2Q3LI59 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
KRTAP21-2Q3LI59 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
KRTAP21-2Q3LI59 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
KRTAP21-2Q3LI59 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
KRTAP21-2Q3LI59 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
KRTAP21-2Q3LI59 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
KRTAP21-2Q3LI59 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
KRTAP21-2Q3LI59 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
KRTAP21-2Q3LI59 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
KRTAP21-2Q3LI59 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
KRTAP21-2Q3LI59 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
KRTAP21-2Q3LI59 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
KRTAP21-2Q3LI59 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
KRTAP21-2Q3LI59 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
KRTAP21-2Q3LI59 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
KRTAP21-2Q3LI59 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
KRTAP21-2Q3LI59 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
KRTAP21-2Q3LI59 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
KRTAP21-2Q3LI59 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
KRTAP21-2Q3LI59 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC4.55□□□□□ -1.68
KRTAP21-2Q3LI59 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
KRTAP21-2Q3LI59 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
KRTAP21-2Q3LI59 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
KRTAP21-2Q3LI59 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
KRTAP21-2Q3LI59 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
KRTAP21-2Q3LI59 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
KRTAP21-2Q3LI59 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
KRTAP21-2Q3LI59 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
KRTAP21-2Q3LI59 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
KRTAP21-2Q3LI59 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
KRTAP21-2Q3LI59 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
KRTAP21-2Q3LI59 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
KRTAP21-2Q3LI59 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
KRTAP21-2Q3LI59 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
KRTAP21-2Q3LI59 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
KRTAP21-2Q3LI59 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
KRTAP21-2Q3LI59 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
KRTAP21-2Q3LI59 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
KRTAP21-2Q3LI59 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
KRTAP21-2Q3LI59 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
KRTAP21-2Q3LI59 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
KRTAP21-2Q3LI59 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
KRTAP21-2Q3LI59 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
KRTAP21-2Q3LI59 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
KRTAP21-2Q3LI59 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
KRTAP21-2Q3LI59 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
KRTAP21-2Q3LI59 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
KRTAP21-2Q3LI59 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
KRTAP21-2Q3LI59 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
KRTAP21-2Q3LI59 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
KRTAP21-2Q3LI59 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
KRTAP21-2Q3LI59 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
KRTAP21-2Q3LI59 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
KRTAP21-2Q3LI59 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
KRTAP21-2Q3LI59 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
KRTAP21-2Q3LI59 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
KRTAP21-2Q3LI59 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
KRTAP21-2Q3LI59 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
KRTAP21-2Q3LI59 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
KRTAP21-2Q3LI59 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
KRTAP21-2Q3LI59 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
KRTAP21-2Q3LI59 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
KRTAP21-2Q3LI59 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
KRTAP21-2Q3LI59 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
KRTAP21-2Q3LI59 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms