Protein–RNA interactions for Protein: Q3C1V8

BSX, Brain-specific homeobox protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BSXQ3C1V8 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BSXQ3C1V8 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BSXQ3C1V8 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
BSXQ3C1V8 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
BSXQ3C1V8 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
BSXQ3C1V8 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
BSXQ3C1V8 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
BSXQ3C1V8 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
BSXQ3C1V8 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BSXQ3C1V8 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BSXQ3C1V8 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BSXQ3C1V8 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BSXQ3C1V8 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BSXQ3C1V8 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BSXQ3C1V8 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
BSXQ3C1V8 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BSXQ3C1V8 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BSXQ3C1V8 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BSXQ3C1V8 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BSXQ3C1V8 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BSXQ3C1V8 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BSXQ3C1V8 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BSXQ3C1V8 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BSXQ3C1V8 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BSXQ3C1V8 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BSXQ3C1V8 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BSXQ3C1V8 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BSXQ3C1V8 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BSXQ3C1V8 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BSXQ3C1V8 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BSXQ3C1V8 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BSXQ3C1V8 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BSXQ3C1V8 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BSXQ3C1V8 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BSXQ3C1V8 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BSXQ3C1V8 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BSXQ3C1V8 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BSXQ3C1V8 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BSXQ3C1V8 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BSXQ3C1V8 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BSXQ3C1V8 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BSXQ3C1V8 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BSXQ3C1V8 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BSXQ3C1V8 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BSXQ3C1V8 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BSXQ3C1V8 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BSXQ3C1V8 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BSXQ3C1V8 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BSXQ3C1V8 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BSXQ3C1V8 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BSXQ3C1V8 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BSXQ3C1V8 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BSXQ3C1V8 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BSXQ3C1V8 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BSXQ3C1V8 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BSXQ3C1V8 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BSXQ3C1V8 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BSXQ3C1V8 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BSXQ3C1V8 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BSXQ3C1V8 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BSXQ3C1V8 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BSXQ3C1V8 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BSXQ3C1V8 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BSXQ3C1V8 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BSXQ3C1V8 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BSXQ3C1V8 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BSXQ3C1V8 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BSXQ3C1V8 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BSXQ3C1V8 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BSXQ3C1V8 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BSXQ3C1V8 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BSXQ3C1V8 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
BSXQ3C1V8 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BSXQ3C1V8 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BSXQ3C1V8 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BSXQ3C1V8 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BSXQ3C1V8 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BSXQ3C1V8 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BSXQ3C1V8 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BSXQ3C1V8 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BSXQ3C1V8 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BSXQ3C1V8 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BSXQ3C1V8 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BSXQ3C1V8 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BSXQ3C1V8 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BSXQ3C1V8 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BSXQ3C1V8 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BSXQ3C1V8 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
BSXQ3C1V8 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BSXQ3C1V8 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BSXQ3C1V8 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BSXQ3C1V8 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BSXQ3C1V8 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BSXQ3C1V8 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BSXQ3C1V8 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BSXQ3C1V8 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BSXQ3C1V8 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BSXQ3C1V8 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BSXQ3C1V8 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BSXQ3C1V8 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms