Protein–RNA interactions for Protein: Q2Y0W8

SLC4A8, Electroneutral sodium bicarbonate exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A8Q2Y0W8 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SLC4A8Q2Y0W8 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SLC4A8Q2Y0W8 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SLC4A8Q2Y0W8 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SLC4A8Q2Y0W8 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SLC4A8Q2Y0W8 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SLC4A8Q2Y0W8 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SLC4A8Q2Y0W8 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SLC4A8Q2Y0W8 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SLC4A8Q2Y0W8 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SLC4A8Q2Y0W8 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SLC4A8Q2Y0W8 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SLC4A8Q2Y0W8 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SLC4A8Q2Y0W8 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
SLC4A8Q2Y0W8 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
SLC4A8Q2Y0W8 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SLC4A8Q2Y0W8 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SLC4A8Q2Y0W8 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLC4A8Q2Y0W8 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLC4A8Q2Y0W8 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLC4A8Q2Y0W8 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLC4A8Q2Y0W8 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
SLC4A8Q2Y0W8 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLC4A8Q2Y0W8 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLC4A8Q2Y0W8 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SLC4A8Q2Y0W8 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SLC4A8Q2Y0W8 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SLC4A8Q2Y0W8 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SLC4A8Q2Y0W8 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SLC4A8Q2Y0W8 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
SLC4A8Q2Y0W8 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SLC4A8Q2Y0W8 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SLC4A8Q2Y0W8 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SLC4A8Q2Y0W8 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SLC4A8Q2Y0W8 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SLC4A8Q2Y0W8 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SLC4A8Q2Y0W8 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SLC4A8Q2Y0W8 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SLC4A8Q2Y0W8 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SLC4A8Q2Y0W8 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
SLC4A8Q2Y0W8 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SLC4A8Q2Y0W8 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SLC4A8Q2Y0W8 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SLC4A8Q2Y0W8 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SLC4A8Q2Y0W8 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SLC4A8Q2Y0W8 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SLC4A8Q2Y0W8 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SLC4A8Q2Y0W8 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
SLC4A8Q2Y0W8 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SLC4A8Q2Y0W8 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SLC4A8Q2Y0W8 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SLC4A8Q2Y0W8 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SLC4A8Q2Y0W8 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SLC4A8Q2Y0W8 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SLC4A8Q2Y0W8 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SLC4A8Q2Y0W8 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SLC4A8Q2Y0W8 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SLC4A8Q2Y0W8 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SLC4A8Q2Y0W8 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SLC4A8Q2Y0W8 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SLC4A8Q2Y0W8 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SLC4A8Q2Y0W8 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SLC4A8Q2Y0W8 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC27.54■■■□□ 2
SLC4A8Q2Y0W8 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SLC4A8Q2Y0W8 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SLC4A8Q2Y0W8 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SLC4A8Q2Y0W8 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
SLC4A8Q2Y0W8 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
SLC4A8Q2Y0W8 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SLC4A8Q2Y0W8 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SLC4A8Q2Y0W8 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC27.52■■■□□ 2
SLC4A8Q2Y0W8 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SLC4A8Q2Y0W8 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
SLC4A8Q2Y0W8 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SLC4A8Q2Y0W8 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SLC4A8Q2Y0W8 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SLC4A8Q2Y0W8 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
SLC4A8Q2Y0W8 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
SLC4A8Q2Y0W8 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SLC4A8Q2Y0W8 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SLC4A8Q2Y0W8 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SLC4A8Q2Y0W8 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SLC4A8Q2Y0W8 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SLC4A8Q2Y0W8 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SLC4A8Q2Y0W8 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SLC4A8Q2Y0W8 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SLC4A8Q2Y0W8 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SLC4A8Q2Y0W8 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
SLC4A8Q2Y0W8 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SLC4A8Q2Y0W8 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SLC4A8Q2Y0W8 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SLC4A8Q2Y0W8 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SLC4A8Q2Y0W8 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SLC4A8Q2Y0W8 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SLC4A8Q2Y0W8 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SLC4A8Q2Y0W8 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SLC4A8Q2Y0W8 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SLC4A8Q2Y0W8 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SLC4A8Q2Y0W8 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
SLC4A8Q2Y0W8 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms