Protein–RNA interactions for Protein: Q2MJR0

SPRED3, Sprouty-related, EVH1 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRED3Q2MJR0 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SPRED3Q2MJR0 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SPRED3Q2MJR0 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SPRED3Q2MJR0 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SPRED3Q2MJR0 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SPRED3Q2MJR0 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SPRED3Q2MJR0 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SPRED3Q2MJR0 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SPRED3Q2MJR0 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SPRED3Q2MJR0 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SPRED3Q2MJR0 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SPRED3Q2MJR0 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SPRED3Q2MJR0 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SPRED3Q2MJR0 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SPRED3Q2MJR0 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SPRED3Q2MJR0 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SPRED3Q2MJR0 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SPRED3Q2MJR0 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SPRED3Q2MJR0 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SPRED3Q2MJR0 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SPRED3Q2MJR0 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SPRED3Q2MJR0 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SPRED3Q2MJR0 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SPRED3Q2MJR0 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SPRED3Q2MJR0 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SPRED3Q2MJR0 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SPRED3Q2MJR0 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SPRED3Q2MJR0 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SPRED3Q2MJR0 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SPRED3Q2MJR0 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SPRED3Q2MJR0 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPRED3Q2MJR0 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPRED3Q2MJR0 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPRED3Q2MJR0 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPRED3Q2MJR0 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPRED3Q2MJR0 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPRED3Q2MJR0 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPRED3Q2MJR0 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPRED3Q2MJR0 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPRED3Q2MJR0 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPRED3Q2MJR0 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPRED3Q2MJR0 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPRED3Q2MJR0 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPRED3Q2MJR0 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPRED3Q2MJR0 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SPRED3Q2MJR0 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPRED3Q2MJR0 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPRED3Q2MJR0 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPRED3Q2MJR0 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPRED3Q2MJR0 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPRED3Q2MJR0 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPRED3Q2MJR0 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPRED3Q2MJR0 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPRED3Q2MJR0 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPRED3Q2MJR0 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPRED3Q2MJR0 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPRED3Q2MJR0 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPRED3Q2MJR0 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPRED3Q2MJR0 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPRED3Q2MJR0 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SPRED3Q2MJR0 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SPRED3Q2MJR0 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SPRED3Q2MJR0 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SPRED3Q2MJR0 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SPRED3Q2MJR0 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SPRED3Q2MJR0 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SPRED3Q2MJR0 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SPRED3Q2MJR0 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SPRED3Q2MJR0 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SPRED3Q2MJR0 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SPRED3Q2MJR0 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPRED3Q2MJR0 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPRED3Q2MJR0 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPRED3Q2MJR0 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPRED3Q2MJR0 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPRED3Q2MJR0 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPRED3Q2MJR0 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPRED3Q2MJR0 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPRED3Q2MJR0 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPRED3Q2MJR0 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPRED3Q2MJR0 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPRED3Q2MJR0 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SPRED3Q2MJR0 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPRED3Q2MJR0 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPRED3Q2MJR0 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPRED3Q2MJR0 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPRED3Q2MJR0 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPRED3Q2MJR0 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPRED3Q2MJR0 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPRED3Q2MJR0 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPRED3Q2MJR0 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPRED3Q2MJR0 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPRED3Q2MJR0 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SPRED3Q2MJR0 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPRED3Q2MJR0 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SPRED3Q2MJR0 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPRED3Q2MJR0 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPRED3Q2MJR0 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPRED3Q2MJR0 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPRED3Q2MJR0 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms