Protein–RNA interactions for Protein: Q16821

PPP1R3A, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 3A, humanhuman

Predictions only

Length 1,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R3AQ16821 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPP1R3AQ16821 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPP1R3AQ16821 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPP1R3AQ16821 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPP1R3AQ16821 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPP1R3AQ16821 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPP1R3AQ16821 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPP1R3AQ16821 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPP1R3AQ16821 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPP1R3AQ16821 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPP1R3AQ16821 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPP1R3AQ16821 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPP1R3AQ16821 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPP1R3AQ16821 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPP1R3AQ16821 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPP1R3AQ16821 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPP1R3AQ16821 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPP1R3AQ16821 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPP1R3AQ16821 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPP1R3AQ16821 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PPP1R3AQ16821 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPP1R3AQ16821 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PPP1R3AQ16821 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPP1R3AQ16821 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPP1R3AQ16821 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPP1R3AQ16821 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPP1R3AQ16821 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPP1R3AQ16821 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPP1R3AQ16821 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPP1R3AQ16821 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPP1R3AQ16821 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPP1R3AQ16821 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPP1R3AQ16821 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPP1R3AQ16821 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPP1R3AQ16821 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPP1R3AQ16821 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPP1R3AQ16821 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPP1R3AQ16821 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPP1R3AQ16821 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PPP1R3AQ16821 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
PPP1R3AQ16821 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PPP1R3AQ16821 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PPP1R3AQ16821 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PPP1R3AQ16821 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PPP1R3AQ16821 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PPP1R3AQ16821 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PPP1R3AQ16821 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PPP1R3AQ16821 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPP1R3AQ16821 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPP1R3AQ16821 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPP1R3AQ16821 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPP1R3AQ16821 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPP1R3AQ16821 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPP1R3AQ16821 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPP1R3AQ16821 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPP1R3AQ16821 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PPP1R3AQ16821 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PPP1R3AQ16821 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPP1R3AQ16821 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPP1R3AQ16821 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PPP1R3AQ16821 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPP1R3AQ16821 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PPP1R3AQ16821 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPP1R3AQ16821 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPP1R3AQ16821 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPP1R3AQ16821 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPP1R3AQ16821 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPP1R3AQ16821 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPP1R3AQ16821 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPP1R3AQ16821 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPP1R3AQ16821 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPP1R3AQ16821 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPP1R3AQ16821 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPP1R3AQ16821 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPP1R3AQ16821 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPP1R3AQ16821 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPP1R3AQ16821 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPP1R3AQ16821 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPP1R3AQ16821 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPP1R3AQ16821 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPP1R3AQ16821 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPP1R3AQ16821 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPP1R3AQ16821 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPP1R3AQ16821 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPP1R3AQ16821 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PPP1R3AQ16821 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPP1R3AQ16821 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PPP1R3AQ16821 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPP1R3AQ16821 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPP1R3AQ16821 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPP1R3AQ16821 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPP1R3AQ16821 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PPP1R3AQ16821 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PPP1R3AQ16821 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PPP1R3AQ16821 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PPP1R3AQ16821 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PPP1R3AQ16821 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PPP1R3AQ16821 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PPP1R3AQ16821 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PPP1R3AQ16821 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms