Protein–RNA interactions for Protein: Q16795

NDUFA9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA9Q16795 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NDUFA9Q16795 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NDUFA9Q16795 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NDUFA9Q16795 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NDUFA9Q16795 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NDUFA9Q16795 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NDUFA9Q16795 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NDUFA9Q16795 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NDUFA9Q16795 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NDUFA9Q16795 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NDUFA9Q16795 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NDUFA9Q16795 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NDUFA9Q16795 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NDUFA9Q16795 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NDUFA9Q16795 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NDUFA9Q16795 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NDUFA9Q16795 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NDUFA9Q16795 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NDUFA9Q16795 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NDUFA9Q16795 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NDUFA9Q16795 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NDUFA9Q16795 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NDUFA9Q16795 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NDUFA9Q16795 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NDUFA9Q16795 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NDUFA9Q16795 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NDUFA9Q16795 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NDUFA9Q16795 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NDUFA9Q16795 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NDUFA9Q16795 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NDUFA9Q16795 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NDUFA9Q16795 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NDUFA9Q16795 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NDUFA9Q16795 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NDUFA9Q16795 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NDUFA9Q16795 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NDUFA9Q16795 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NDUFA9Q16795 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NDUFA9Q16795 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NDUFA9Q16795 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NDUFA9Q16795 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NDUFA9Q16795 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NDUFA9Q16795 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NDUFA9Q16795 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NDUFA9Q16795 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NDUFA9Q16795 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NDUFA9Q16795 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NDUFA9Q16795 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NDUFA9Q16795 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NDUFA9Q16795 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NDUFA9Q16795 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NDUFA9Q16795 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NDUFA9Q16795 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NDUFA9Q16795 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NDUFA9Q16795 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NDUFA9Q16795 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NDUFA9Q16795 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NDUFA9Q16795 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NDUFA9Q16795 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NDUFA9Q16795 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NDUFA9Q16795 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NDUFA9Q16795 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NDUFA9Q16795 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NDUFA9Q16795 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
NDUFA9Q16795 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NDUFA9Q16795 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NDUFA9Q16795 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NDUFA9Q16795 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NDUFA9Q16795 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NDUFA9Q16795 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NDUFA9Q16795 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NDUFA9Q16795 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NDUFA9Q16795 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NDUFA9Q16795 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NDUFA9Q16795 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NDUFA9Q16795 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NDUFA9Q16795 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NDUFA9Q16795 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NDUFA9Q16795 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NDUFA9Q16795 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NDUFA9Q16795 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
NDUFA9Q16795 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
NDUFA9Q16795 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NDUFA9Q16795 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NDUFA9Q16795 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NDUFA9Q16795 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NDUFA9Q16795 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NDUFA9Q16795 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NDUFA9Q16795 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NDUFA9Q16795 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NDUFA9Q16795 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NDUFA9Q16795 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NDUFA9Q16795 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NDUFA9Q16795 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NDUFA9Q16795 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NDUFA9Q16795 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NDUFA9Q16795 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NDUFA9Q16795 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NDUFA9Q16795 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NDUFA9Q16795 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
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