Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NRF1Q16656 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NRF1Q16656 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NRF1Q16656 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NRF1Q16656 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NRF1Q16656 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NRF1Q16656 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NRF1Q16656 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NRF1Q16656 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NRF1Q16656 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NRF1Q16656 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NRF1Q16656 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NRF1Q16656 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NRF1Q16656 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NRF1Q16656 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NRF1Q16656 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
NRF1Q16656 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NRF1Q16656 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NRF1Q16656 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NRF1Q16656 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NRF1Q16656 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NRF1Q16656 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
NRF1Q16656 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NRF1Q16656 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NRF1Q16656 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NRF1Q16656 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NRF1Q16656 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NRF1Q16656 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NRF1Q16656 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NRF1Q16656 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NRF1Q16656 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NRF1Q16656 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NRF1Q16656 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NRF1Q16656 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NRF1Q16656 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
NRF1Q16656 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
NRF1Q16656 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NRF1Q16656 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NRF1Q16656 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NRF1Q16656 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NRF1Q16656 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NRF1Q16656 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
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NRF1Q16656 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NRF1Q16656 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NRF1Q16656 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
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NRF1Q16656 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
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NRF1Q16656 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
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NRF1Q16656 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
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NRF1Q16656 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
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NRF1Q16656 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NRF1Q16656 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
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NRF1Q16656 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NRF1Q16656 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NRF1Q16656 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NRF1Q16656 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NRF1Q16656 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NRF1Q16656 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NRF1Q16656 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NRF1Q16656 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
NRF1Q16656 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
NRF1Q16656 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NRF1Q16656 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
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