Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SNAPC1Q16533 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SNAPC1Q16533 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SNAPC1Q16533 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SNAPC1Q16533 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SNAPC1Q16533 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SNAPC1Q16533 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
SNAPC1Q16533 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SNAPC1Q16533 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SNAPC1Q16533 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SNAPC1Q16533 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SNAPC1Q16533 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SNAPC1Q16533 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SNAPC1Q16533 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SNAPC1Q16533 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SNAPC1Q16533 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SNAPC1Q16533 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SNAPC1Q16533 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SNAPC1Q16533 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SNAPC1Q16533 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SNAPC1Q16533 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SNAPC1Q16533 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SNAPC1Q16533 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
SNAPC1Q16533 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SNAPC1Q16533 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SNAPC1Q16533 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SNAPC1Q16533 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SNAPC1Q16533 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SNAPC1Q16533 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SNAPC1Q16533 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SNAPC1Q16533 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SNAPC1Q16533 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SNAPC1Q16533 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SNAPC1Q16533 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SNAPC1Q16533 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SNAPC1Q16533 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SNAPC1Q16533 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SNAPC1Q16533 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SNAPC1Q16533 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SNAPC1Q16533 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SNAPC1Q16533 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SNAPC1Q16533 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SNAPC1Q16533 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SNAPC1Q16533 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SNAPC1Q16533 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SNAPC1Q16533 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SNAPC1Q16533 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SNAPC1Q16533 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SNAPC1Q16533 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
SNAPC1Q16533 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SNAPC1Q16533 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SNAPC1Q16533 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SNAPC1Q16533 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SNAPC1Q16533 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SNAPC1Q16533 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SNAPC1Q16533 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SNAPC1Q16533 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SNAPC1Q16533 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SNAPC1Q16533 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SNAPC1Q16533 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SNAPC1Q16533 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SNAPC1Q16533 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SNAPC1Q16533 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SNAPC1Q16533 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
SNAPC1Q16533 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SNAPC1Q16533 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SNAPC1Q16533 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SNAPC1Q16533 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SNAPC1Q16533 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SNAPC1Q16533 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SNAPC1Q16533 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SNAPC1Q16533 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SNAPC1Q16533 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SNAPC1Q16533 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SNAPC1Q16533 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SNAPC1Q16533 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SNAPC1Q16533 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SNAPC1Q16533 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SNAPC1Q16533 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SNAPC1Q16533 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SNAPC1Q16533 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SNAPC1Q16533 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SNAPC1Q16533 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SNAPC1Q16533 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SNAPC1Q16533 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SNAPC1Q16533 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SNAPC1Q16533 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SNAPC1Q16533 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SNAPC1Q16533 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SNAPC1Q16533 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SNAPC1Q16533 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SNAPC1Q16533 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SNAPC1Q16533 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SNAPC1Q16533 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SNAPC1Q16533 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SNAPC1Q16533 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SNAPC1Q16533 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SNAPC1Q16533 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SNAPC1Q16533 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SNAPC1Q16533 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms