Protein–RNA interactions for Protein: Q16473

TNXA, Putative tenascin-XA, humanhuman

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Length 311 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNXAQ16473 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNXAQ16473 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNXAQ16473 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNXAQ16473 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNXAQ16473 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNXAQ16473 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TNXAQ16473 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TNXAQ16473 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TNXAQ16473 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNXAQ16473 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNXAQ16473 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNXAQ16473 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TNXAQ16473 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TNXAQ16473 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNXAQ16473 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNXAQ16473 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNXAQ16473 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNXAQ16473 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNXAQ16473 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNXAQ16473 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNXAQ16473 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNXAQ16473 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNXAQ16473 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNXAQ16473 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNXAQ16473 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNXAQ16473 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNXAQ16473 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNXAQ16473 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNXAQ16473 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNXAQ16473 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TNXAQ16473 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TNXAQ16473 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TNXAQ16473 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TNXAQ16473 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TNXAQ16473 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TNXAQ16473 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TNXAQ16473 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TNXAQ16473 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TNXAQ16473 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TNXAQ16473 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TNXAQ16473 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TNXAQ16473 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TNXAQ16473 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TNXAQ16473 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNXAQ16473 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNXAQ16473 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNXAQ16473 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNXAQ16473 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNXAQ16473 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNXAQ16473 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
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TNXAQ16473 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNXAQ16473 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNXAQ16473 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNXAQ16473 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNXAQ16473 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNXAQ16473 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNXAQ16473 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNXAQ16473 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNXAQ16473 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNXAQ16473 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNXAQ16473 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNXAQ16473 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNXAQ16473 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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TNXAQ16473 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNXAQ16473 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNXAQ16473 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNXAQ16473 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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TNXAQ16473 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TNXAQ16473 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
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TNXAQ16473 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TNXAQ16473 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TNXAQ16473 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TNXAQ16473 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
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TNXAQ16473 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
TNXAQ16473 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TNXAQ16473 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TNXAQ16473 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TNXAQ16473 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TNXAQ16473 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TNXAQ16473 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TNXAQ16473 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TNXAQ16473 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TNXAQ16473 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TNXAQ16473 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TNXAQ16473 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TNXAQ16473 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TNXAQ16473 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TNXAQ16473 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TNXAQ16473 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TNXAQ16473 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TNXAQ16473 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNXAQ16473 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNXAQ16473 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
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