Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SSX1Q16384 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SSX1Q16384 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SSX1Q16384 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SSX1Q16384 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SSX1Q16384 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SSX1Q16384 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SSX1Q16384 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SSX1Q16384 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SSX1Q16384 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SSX1Q16384 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SSX1Q16384 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SSX1Q16384 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SSX1Q16384 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SSX1Q16384 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SSX1Q16384 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SSX1Q16384 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SSX1Q16384 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SSX1Q16384 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SSX1Q16384 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SSX1Q16384 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SSX1Q16384 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SSX1Q16384 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SSX1Q16384 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SSX1Q16384 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SSX1Q16384 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SSX1Q16384 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SSX1Q16384 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SSX1Q16384 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SSX1Q16384 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SSX1Q16384 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SSX1Q16384 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SSX1Q16384 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SSX1Q16384 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SSX1Q16384 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SSX1Q16384 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SSX1Q16384 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SSX1Q16384 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SSX1Q16384 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SSX1Q16384 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SSX1Q16384 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SSX1Q16384 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SSX1Q16384 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SSX1Q16384 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SSX1Q16384 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SSX1Q16384 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SSX1Q16384 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SSX1Q16384 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SSX1Q16384 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SSX1Q16384 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SSX1Q16384 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SSX1Q16384 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SSX1Q16384 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SSX1Q16384 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SSX1Q16384 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SSX1Q16384 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SSX1Q16384 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
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SSX1Q16384 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SSX1Q16384 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SSX1Q16384 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SSX1Q16384 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SSX1Q16384 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SSX1Q16384 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SSX1Q16384 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SSX1Q16384 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SSX1Q16384 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SSX1Q16384 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SSX1Q16384 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SSX1Q16384 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SSX1Q16384 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SSX1Q16384 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SSX1Q16384 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
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SSX1Q16384 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SSX1Q16384 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SSX1Q16384 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SSX1Q16384 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SSX1Q16384 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SSX1Q16384 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SSX1Q16384 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SSX1Q16384 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SSX1Q16384 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SSX1Q16384 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SSX1Q16384 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SSX1Q16384 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SSX1Q16384 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SSX1Q16384 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SSX1Q16384 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SSX1Q16384 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SSX1Q16384 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SSX1Q16384 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SSX1Q16384 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SSX1Q16384 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SSX1Q16384 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SSX1Q16384 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SSX1Q16384 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SSX1Q16384 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SSX1Q16384 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SSX1Q16384 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
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