Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ZFHX3Q15911 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ZFHX3Q15911 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ZFHX3Q15911 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ZFHX3Q15911 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ZFHX3Q15911 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ZFHX3Q15911 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ZFHX3Q15911 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ZFHX3Q15911 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ZFHX3Q15911 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
ZFHX3Q15911 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ZFHX3Q15911 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
ZFHX3Q15911 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ZFHX3Q15911 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ZFHX3Q15911 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ZFHX3Q15911 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ZFHX3Q15911 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ZFHX3Q15911 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ZFHX3Q15911 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ZFHX3Q15911 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
ZFHX3Q15911 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ZFHX3Q15911 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ZFHX3Q15911 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ZFHX3Q15911 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ZFHX3Q15911 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ZFHX3Q15911 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ZFHX3Q15911 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ZFHX3Q15911 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
ZFHX3Q15911 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ZFHX3Q15911 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ZFHX3Q15911 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ZFHX3Q15911 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ZFHX3Q15911 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ZFHX3Q15911 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ZFHX3Q15911 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ZFHX3Q15911 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ZFHX3Q15911 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ZFHX3Q15911 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ZFHX3Q15911 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZFHX3Q15911 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZFHX3Q15911 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZFHX3Q15911 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZFHX3Q15911 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZFHX3Q15911 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZFHX3Q15911 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZFHX3Q15911 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZFHX3Q15911 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
ZFHX3Q15911 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ZFHX3Q15911 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ZFHX3Q15911 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
ZFHX3Q15911 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
ZFHX3Q15911 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
ZFHX3Q15911 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
ZFHX3Q15911 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
ZFHX3Q15911 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZFHX3Q15911 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZFHX3Q15911 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZFHX3Q15911 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZFHX3Q15911 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZFHX3Q15911 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZFHX3Q15911 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZFHX3Q15911 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZFHX3Q15911 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZFHX3Q15911 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZFHX3Q15911 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZFHX3Q15911 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZFHX3Q15911 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZFHX3Q15911 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
ZFHX3Q15911 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZFHX3Q15911 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZFHX3Q15911 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZFHX3Q15911 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZFHX3Q15911 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZFHX3Q15911 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZFHX3Q15911 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZFHX3Q15911 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZFHX3Q15911 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZFHX3Q15911 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZFHX3Q15911 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZFHX3Q15911 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZFHX3Q15911 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZFHX3Q15911 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ZFHX3Q15911 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ZFHX3Q15911 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ZFHX3Q15911 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ZFHX3Q15911 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ZFHX3Q15911 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.67
ZFHX3Q15911 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.67
ZFHX3Q15911 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
ZFHX3Q15911 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ZFHX3Q15911 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ZFHX3Q15911 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ZFHX3Q15911 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ZFHX3Q15911 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ZFHX3Q15911 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ZFHX3Q15911 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
ZFHX3Q15911 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ZFHX3Q15911 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ZFHX3Q15911 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ZFHX3Q15911 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
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