Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP6AP1Q15904 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATP6AP1Q15904 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATP6AP1Q15904 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATP6AP1Q15904 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATP6AP1Q15904 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATP6AP1Q15904 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ATP6AP1Q15904 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATP6AP1Q15904 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATP6AP1Q15904 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATP6AP1Q15904 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATP6AP1Q15904 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATP6AP1Q15904 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATP6AP1Q15904 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATP6AP1Q15904 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATP6AP1Q15904 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATP6AP1Q15904 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATP6AP1Q15904 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATP6AP1Q15904 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATP6AP1Q15904 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ATP6AP1Q15904 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ATP6AP1Q15904 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP6AP1Q15904 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP6AP1Q15904 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP6AP1Q15904 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP6AP1Q15904 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP6AP1Q15904 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP6AP1Q15904 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP6AP1Q15904 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP6AP1Q15904 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP6AP1Q15904 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP6AP1Q15904 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP6AP1Q15904 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP6AP1Q15904 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP6AP1Q15904 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP6AP1Q15904 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP6AP1Q15904 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP6AP1Q15904 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP6AP1Q15904 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP6AP1Q15904 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP6AP1Q15904 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP6AP1Q15904 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP6AP1Q15904 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP6AP1Q15904 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP6AP1Q15904 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP6AP1Q15904 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP6AP1Q15904 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP6AP1Q15904 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP6AP1Q15904 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP6AP1Q15904 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP6AP1Q15904 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP6AP1Q15904 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP6AP1Q15904 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP6AP1Q15904 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP6AP1Q15904 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP6AP1Q15904 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP6AP1Q15904 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP6AP1Q15904 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP6AP1Q15904 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP6AP1Q15904 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP6AP1Q15904 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP6AP1Q15904 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP6AP1Q15904 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP6AP1Q15904 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP6AP1Q15904 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP6AP1Q15904 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP6AP1Q15904 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP6AP1Q15904 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP6AP1Q15904 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP6AP1Q15904 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP6AP1Q15904 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP6AP1Q15904 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP6AP1Q15904 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP6AP1Q15904 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP6AP1Q15904 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP6AP1Q15904 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP6AP1Q15904 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP6AP1Q15904 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP6AP1Q15904 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP6AP1Q15904 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP6AP1Q15904 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP6AP1Q15904 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP6AP1Q15904 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP6AP1Q15904 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP6AP1Q15904 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP6AP1Q15904 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP6AP1Q15904 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP6AP1Q15904 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
ATP6AP1Q15904 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP6AP1Q15904 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP6AP1Q15904 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP6AP1Q15904 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP6AP1Q15904 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP6AP1Q15904 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP6AP1Q15904 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP6AP1Q15904 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP6AP1Q15904 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP6AP1Q15904 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP6AP1Q15904 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP6AP1Q15904 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
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