Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHRNA6Q15825 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHRNA6Q15825 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHRNA6Q15825 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHRNA6Q15825 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHRNA6Q15825 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHRNA6Q15825 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHRNA6Q15825 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHRNA6Q15825 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHRNA6Q15825 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHRNA6Q15825 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHRNA6Q15825 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHRNA6Q15825 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHRNA6Q15825 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHRNA6Q15825 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHRNA6Q15825 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHRNA6Q15825 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHRNA6Q15825 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHRNA6Q15825 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHRNA6Q15825 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CHRNA6Q15825 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHRNA6Q15825 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHRNA6Q15825 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHRNA6Q15825 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CHRNA6Q15825 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHRNA6Q15825 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHRNA6Q15825 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHRNA6Q15825 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHRNA6Q15825 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHRNA6Q15825 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHRNA6Q15825 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHRNA6Q15825 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CHRNA6Q15825 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHRNA6Q15825 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHRNA6Q15825 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHRNA6Q15825 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHRNA6Q15825 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CHRNA6Q15825 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHRNA6Q15825 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CHRNA6Q15825 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHRNA6Q15825 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHRNA6Q15825 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHRNA6Q15825 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHRNA6Q15825 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHRNA6Q15825 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHRNA6Q15825 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHRNA6Q15825 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHRNA6Q15825 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHRNA6Q15825 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHRNA6Q15825 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHRNA6Q15825 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHRNA6Q15825 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHRNA6Q15825 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHRNA6Q15825 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHRNA6Q15825 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHRNA6Q15825 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHRNA6Q15825 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHRNA6Q15825 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHRNA6Q15825 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHRNA6Q15825 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CHRNA6Q15825 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHRNA6Q15825 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHRNA6Q15825 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHRNA6Q15825 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHRNA6Q15825 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHRNA6Q15825 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHRNA6Q15825 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHRNA6Q15825 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHRNA6Q15825 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHRNA6Q15825 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHRNA6Q15825 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CHRNA6Q15825 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CHRNA6Q15825 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHRNA6Q15825 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHRNA6Q15825 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CHRNA6Q15825 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHRNA6Q15825 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHRNA6Q15825 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHRNA6Q15825 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHRNA6Q15825 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHRNA6Q15825 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHRNA6Q15825 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHRNA6Q15825 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHRNA6Q15825 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHRNA6Q15825 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHRNA6Q15825 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHRNA6Q15825 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHRNA6Q15825 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHRNA6Q15825 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHRNA6Q15825 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHRNA6Q15825 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHRNA6Q15825 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHRNA6Q15825 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHRNA6Q15825 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CHRNA6Q15825 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CHRNA6Q15825 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHRNA6Q15825 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHRNA6Q15825 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHRNA6Q15825 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CHRNA6Q15825 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms