Protein–RNA interactions for Protein: Q15645

TRIP13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP13Q15645 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIP13Q15645 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIP13Q15645 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIP13Q15645 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIP13Q15645 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIP13Q15645 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIP13Q15645 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIP13Q15645 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIP13Q15645 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIP13Q15645 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRIP13Q15645 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRIP13Q15645 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRIP13Q15645 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
TRIP13Q15645 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TRIP13Q15645 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TRIP13Q15645 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRIP13Q15645 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRIP13Q15645 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRIP13Q15645 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRIP13Q15645 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRIP13Q15645 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
TRIP13Q15645 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRIP13Q15645 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRIP13Q15645 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRIP13Q15645 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRIP13Q15645 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRIP13Q15645 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRIP13Q15645 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRIP13Q15645 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRIP13Q15645 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRIP13Q15645 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRIP13Q15645 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
TRIP13Q15645 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRIP13Q15645 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
TRIP13Q15645 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRIP13Q15645 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRIP13Q15645 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRIP13Q15645 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRIP13Q15645 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRIP13Q15645 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRIP13Q15645 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRIP13Q15645 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRIP13Q15645 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRIP13Q15645 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRIP13Q15645 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
TRIP13Q15645 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRIP13Q15645 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRIP13Q15645 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRIP13Q15645 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRIP13Q15645 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRIP13Q15645 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRIP13Q15645 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRIP13Q15645 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRIP13Q15645 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRIP13Q15645 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRIP13Q15645 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
TRIP13Q15645 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRIP13Q15645 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRIP13Q15645 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
TRIP13Q15645 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRIP13Q15645 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRIP13Q15645 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRIP13Q15645 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRIP13Q15645 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRIP13Q15645 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRIP13Q15645 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRIP13Q15645 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRIP13Q15645 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRIP13Q15645 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRIP13Q15645 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRIP13Q15645 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
TRIP13Q15645 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRIP13Q15645 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRIP13Q15645 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRIP13Q15645 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRIP13Q15645 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
TRIP13Q15645 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRIP13Q15645 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRIP13Q15645 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRIP13Q15645 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRIP13Q15645 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRIP13Q15645 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIP13Q15645 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIP13Q15645 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIP13Q15645 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIP13Q15645 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIP13Q15645 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIP13Q15645 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIP13Q15645 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIP13Q15645 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIP13Q15645 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIP13Q15645 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIP13Q15645 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIP13Q15645 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIP13Q15645 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIP13Q15645 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIP13Q15645 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIP13Q15645 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIP13Q15645 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIP13Q15645 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms