Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SKIV2LQ15477 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SKIV2LQ15477 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SKIV2LQ15477 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SKIV2LQ15477 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SKIV2LQ15477 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SKIV2LQ15477 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SKIV2LQ15477 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SKIV2LQ15477 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SKIV2LQ15477 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SKIV2LQ15477 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SKIV2LQ15477 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SKIV2LQ15477 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SKIV2LQ15477 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SKIV2LQ15477 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SKIV2LQ15477 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SKIV2LQ15477 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SKIV2LQ15477 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SKIV2LQ15477 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SKIV2LQ15477 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SKIV2LQ15477 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SKIV2LQ15477 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SKIV2LQ15477 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SKIV2LQ15477 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SKIV2LQ15477 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SKIV2LQ15477 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SKIV2LQ15477 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SKIV2LQ15477 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SKIV2LQ15477 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SKIV2LQ15477 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SKIV2LQ15477 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SKIV2LQ15477 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SKIV2LQ15477 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SKIV2LQ15477 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SKIV2LQ15477 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SKIV2LQ15477 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SKIV2LQ15477 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SKIV2LQ15477 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SKIV2LQ15477 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SKIV2LQ15477 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SKIV2LQ15477 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SKIV2LQ15477 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SKIV2LQ15477 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SKIV2LQ15477 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SKIV2LQ15477 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SKIV2LQ15477 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SKIV2LQ15477 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SKIV2LQ15477 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SKIV2LQ15477 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SKIV2LQ15477 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SKIV2LQ15477 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SKIV2LQ15477 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SKIV2LQ15477 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SKIV2LQ15477 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SKIV2LQ15477 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SKIV2LQ15477 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SKIV2LQ15477 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SKIV2LQ15477 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SKIV2LQ15477 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SKIV2LQ15477 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SKIV2LQ15477 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SKIV2LQ15477 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SKIV2LQ15477 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SKIV2LQ15477 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SKIV2LQ15477 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SKIV2LQ15477 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SKIV2LQ15477 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SKIV2LQ15477 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SKIV2LQ15477 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SKIV2LQ15477 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SKIV2LQ15477 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SKIV2LQ15477 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SKIV2LQ15477 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SKIV2LQ15477 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SKIV2LQ15477 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SKIV2LQ15477 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SKIV2LQ15477 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SKIV2LQ15477 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SKIV2LQ15477 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SKIV2LQ15477 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SKIV2LQ15477 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SKIV2LQ15477 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SKIV2LQ15477 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SKIV2LQ15477 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SKIV2LQ15477 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SKIV2LQ15477 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SKIV2LQ15477 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SKIV2LQ15477 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SKIV2LQ15477 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SKIV2LQ15477 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SKIV2LQ15477 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SKIV2LQ15477 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SKIV2LQ15477 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SKIV2LQ15477 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SKIV2LQ15477 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SKIV2LQ15477 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SKIV2LQ15477 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SKIV2LQ15477 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SKIV2LQ15477 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SKIV2LQ15477 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.8 ms