Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

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Length 4,870 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RYR3Q15413 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RYR3Q15413 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RYR3Q15413 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RYR3Q15413 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RYR3Q15413 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RYR3Q15413 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RYR3Q15413 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RYR3Q15413 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RYR3Q15413 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
RYR3Q15413 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RYR3Q15413 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RYR3Q15413 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RYR3Q15413 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RYR3Q15413 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RYR3Q15413 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RYR3Q15413 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RYR3Q15413 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RYR3Q15413 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RYR3Q15413 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RYR3Q15413 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RYR3Q15413 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RYR3Q15413 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RYR3Q15413 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RYR3Q15413 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RYR3Q15413 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RYR3Q15413 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RYR3Q15413 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RYR3Q15413 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RYR3Q15413 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RYR3Q15413 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RYR3Q15413 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RYR3Q15413 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RYR3Q15413 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RYR3Q15413 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RYR3Q15413 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RYR3Q15413 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RYR3Q15413 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RYR3Q15413 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RYR3Q15413 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RYR3Q15413 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RYR3Q15413 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RYR3Q15413 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RYR3Q15413 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RYR3Q15413 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RYR3Q15413 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RYR3Q15413 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RYR3Q15413 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RYR3Q15413 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RYR3Q15413 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RYR3Q15413 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RYR3Q15413 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RYR3Q15413 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
RYR3Q15413 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RYR3Q15413 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RYR3Q15413 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RYR3Q15413 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RYR3Q15413 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RYR3Q15413 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RYR3Q15413 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RYR3Q15413 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RYR3Q15413 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RYR3Q15413 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RYR3Q15413 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RYR3Q15413 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RYR3Q15413 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RYR3Q15413 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RYR3Q15413 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RYR3Q15413 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RYR3Q15413 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RYR3Q15413 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RYR3Q15413 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RYR3Q15413 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RYR3Q15413 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RYR3Q15413 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RYR3Q15413 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RYR3Q15413 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RYR3Q15413 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RYR3Q15413 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RYR3Q15413 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RYR3Q15413 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RYR3Q15413 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RYR3Q15413 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RYR3Q15413 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RYR3Q15413 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RYR3Q15413 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RYR3Q15413 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RYR3Q15413 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RYR3Q15413 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RYR3Q15413 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RYR3Q15413 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RYR3Q15413 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RYR3Q15413 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RYR3Q15413 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RYR3Q15413 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RYR3Q15413 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RYR3Q15413 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RYR3Q15413 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RYR3Q15413 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RYR3Q15413 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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