Protein–RNA interactions for Protein: Q15293

RCN1, Reticulocalbin-1, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCN1Q15293 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RCN1Q15293 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RCN1Q15293 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RCN1Q15293 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RCN1Q15293 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RCN1Q15293 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RCN1Q15293 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RCN1Q15293 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RCN1Q15293 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RCN1Q15293 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RCN1Q15293 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RCN1Q15293 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RCN1Q15293 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RCN1Q15293 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RCN1Q15293 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RCN1Q15293 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RCN1Q15293 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RCN1Q15293 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RCN1Q15293 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RCN1Q15293 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RCN1Q15293 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RCN1Q15293 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RCN1Q15293 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RCN1Q15293 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RCN1Q15293 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RCN1Q15293 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RCN1Q15293 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RCN1Q15293 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RCN1Q15293 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RCN1Q15293 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RCN1Q15293 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RCN1Q15293 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RCN1Q15293 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RCN1Q15293 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RCN1Q15293 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RCN1Q15293 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RCN1Q15293 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RCN1Q15293 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RCN1Q15293 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RCN1Q15293 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RCN1Q15293 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RCN1Q15293 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RCN1Q15293 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RCN1Q15293 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RCN1Q15293 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RCN1Q15293 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RCN1Q15293 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RCN1Q15293 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RCN1Q15293 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RCN1Q15293 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RCN1Q15293 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RCN1Q15293 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RCN1Q15293 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RCN1Q15293 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RCN1Q15293 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RCN1Q15293 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RCN1Q15293 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RCN1Q15293 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RCN1Q15293 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RCN1Q15293 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RCN1Q15293 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RCN1Q15293 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RCN1Q15293 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RCN1Q15293 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RCN1Q15293 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RCN1Q15293 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RCN1Q15293 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RCN1Q15293 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RCN1Q15293 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RCN1Q15293 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RCN1Q15293 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RCN1Q15293 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RCN1Q15293 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RCN1Q15293 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RCN1Q15293 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RCN1Q15293 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RCN1Q15293 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RCN1Q15293 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RCN1Q15293 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RCN1Q15293 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RCN1Q15293 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RCN1Q15293 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RCN1Q15293 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RCN1Q15293 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RCN1Q15293 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RCN1Q15293 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RCN1Q15293 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RCN1Q15293 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RCN1Q15293 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RCN1Q15293 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RCN1Q15293 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RCN1Q15293 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RCN1Q15293 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RCN1Q15293 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RCN1Q15293 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RCN1Q15293 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RCN1Q15293 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RCN1Q15293 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RCN1Q15293 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RCN1Q15293 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms