Protein–RNA interactions for Protein: Q15257

PTPA, Serine/threonine-protein phosphatase 2A activator, humanhuman

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Length 358 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPAQ15257 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPAQ15257 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPAQ15257 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPAQ15257 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPAQ15257 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPAQ15257 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPAQ15257 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPAQ15257 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPAQ15257 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPAQ15257 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPAQ15257 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPAQ15257 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPAQ15257 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPAQ15257 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTPAQ15257 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTPAQ15257 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTPAQ15257 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTPAQ15257 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTPAQ15257 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTPAQ15257 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTPAQ15257 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTPAQ15257 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTPAQ15257 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTPAQ15257 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTPAQ15257 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTPAQ15257 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTPAQ15257 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTPAQ15257 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTPAQ15257 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTPAQ15257 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTPAQ15257 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
PTPAQ15257 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
PTPAQ15257 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTPAQ15257 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTPAQ15257 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTPAQ15257 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTPAQ15257 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTPAQ15257 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTPAQ15257 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTPAQ15257 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTPAQ15257 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTPAQ15257 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTPAQ15257 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
PTPAQ15257 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTPAQ15257 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTPAQ15257 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTPAQ15257 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTPAQ15257 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTPAQ15257 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTPAQ15257 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTPAQ15257 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTPAQ15257 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTPAQ15257 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPAQ15257 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPAQ15257 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPAQ15257 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPAQ15257 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPAQ15257 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPAQ15257 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPAQ15257 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPAQ15257 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPAQ15257 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPAQ15257 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPAQ15257 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPAQ15257 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPAQ15257 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPAQ15257 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPAQ15257 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPAQ15257 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPAQ15257 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPAQ15257 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTPAQ15257 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTPAQ15257 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTPAQ15257 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTPAQ15257 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTPAQ15257 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTPAQ15257 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTPAQ15257 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTPAQ15257 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTPAQ15257 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTPAQ15257 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTPAQ15257 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTPAQ15257 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTPAQ15257 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTPAQ15257 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTPAQ15257 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTPAQ15257 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTPAQ15257 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PTPAQ15257 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PTPAQ15257 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PTPAQ15257 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PTPAQ15257 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PTPAQ15257 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PTPAQ15257 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PTPAQ15257 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PTPAQ15257 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PTPAQ15257 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PTPAQ15257 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
PTPAQ15257 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PTPAQ15257 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
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