Protein–RNA interactions for Protein: Q15118

PDK1, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 1, mitochondrial, humanhuman

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Length 436 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK1Q15118 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDK1Q15118 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDK1Q15118 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDK1Q15118 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PDK1Q15118 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDK1Q15118 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDK1Q15118 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDK1Q15118 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDK1Q15118 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDK1Q15118 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDK1Q15118 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDK1Q15118 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDK1Q15118 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDK1Q15118 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDK1Q15118 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDK1Q15118 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDK1Q15118 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDK1Q15118 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PDK1Q15118 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDK1Q15118 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDK1Q15118 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDK1Q15118 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDK1Q15118 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PDK1Q15118 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDK1Q15118 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDK1Q15118 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
PDK1Q15118 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDK1Q15118 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDK1Q15118 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDK1Q15118 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDK1Q15118 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDK1Q15118 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDK1Q15118 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDK1Q15118 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDK1Q15118 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDK1Q15118 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PDK1Q15118 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDK1Q15118 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDK1Q15118 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDK1Q15118 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDK1Q15118 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDK1Q15118 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDK1Q15118 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDK1Q15118 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDK1Q15118 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDK1Q15118 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDK1Q15118 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDK1Q15118 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDK1Q15118 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDK1Q15118 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDK1Q15118 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDK1Q15118 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDK1Q15118 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDK1Q15118 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDK1Q15118 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDK1Q15118 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDK1Q15118 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDK1Q15118 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDK1Q15118 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDK1Q15118 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDK1Q15118 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDK1Q15118 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDK1Q15118 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDK1Q15118 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDK1Q15118 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDK1Q15118 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDK1Q15118 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDK1Q15118 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDK1Q15118 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDK1Q15118 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDK1Q15118 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PDK1Q15118 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDK1Q15118 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PDK1Q15118 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDK1Q15118 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDK1Q15118 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDK1Q15118 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PDK1Q15118 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDK1Q15118 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDK1Q15118 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDK1Q15118 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDK1Q15118 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PDK1Q15118 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PDK1Q15118 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PDK1Q15118 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
PDK1Q15118 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PDK1Q15118 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PDK1Q15118 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PDK1Q15118 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
PDK1Q15118 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PDK1Q15118 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PDK1Q15118 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PDK1Q15118 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PDK1Q15118 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PDK1Q15118 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDK1Q15118 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDK1Q15118 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDK1Q15118 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDK1Q15118 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDK1Q15118 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
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