Protein–RNA interactions for Protein: Q15036

SNX17, Sorting nexin-17, humanhuman

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Length 470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX17Q15036 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
SNX17Q15036 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SNX17Q15036 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SNX17Q15036 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SNX17Q15036 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SNX17Q15036 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SNX17Q15036 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SNX17Q15036 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SNX17Q15036 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SNX17Q15036 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SNX17Q15036 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
SNX17Q15036 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SNX17Q15036 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SNX17Q15036 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SNX17Q15036 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SNX17Q15036 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SNX17Q15036 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SNX17Q15036 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SNX17Q15036 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SNX17Q15036 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SNX17Q15036 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SNX17Q15036 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SNX17Q15036 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SNX17Q15036 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SNX17Q15036 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SNX17Q15036 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SNX17Q15036 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SNX17Q15036 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SNX17Q15036 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
SNX17Q15036 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SNX17Q15036 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
SNX17Q15036 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SNX17Q15036 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SNX17Q15036 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SNX17Q15036 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
SNX17Q15036 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SNX17Q15036 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
SNX17Q15036 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SNX17Q15036 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SNX17Q15036 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SNX17Q15036 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SNX17Q15036 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
SNX17Q15036 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SNX17Q15036 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SNX17Q15036 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SNX17Q15036 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SNX17Q15036 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SNX17Q15036 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SNX17Q15036 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SNX17Q15036 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SNX17Q15036 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SNX17Q15036 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SNX17Q15036 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SNX17Q15036 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SNX17Q15036 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
SNX17Q15036 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SNX17Q15036 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SNX17Q15036 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SNX17Q15036 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SNX17Q15036 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SNX17Q15036 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SNX17Q15036 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SNX17Q15036 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
SNX17Q15036 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SNX17Q15036 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SNX17Q15036 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SNX17Q15036 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SNX17Q15036 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SNX17Q15036 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SNX17Q15036 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SNX17Q15036 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SNX17Q15036 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SNX17Q15036 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
SNX17Q15036 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SNX17Q15036 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SNX17Q15036 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SNX17Q15036 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SNX17Q15036 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
SNX17Q15036 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SNX17Q15036 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
SNX17Q15036 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SNX17Q15036 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SNX17Q15036 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SNX17Q15036 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SNX17Q15036 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SNX17Q15036 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SNX17Q15036 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SNX17Q15036 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SNX17Q15036 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SNX17Q15036 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SNX17Q15036 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SNX17Q15036 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SNX17Q15036 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SNX17Q15036 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SNX17Q15036 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
SNX17Q15036 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SNX17Q15036 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SNX17Q15036 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SNX17Q15036 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
SNX17Q15036 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
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