Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HERC3Q15034 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HERC3Q15034 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HERC3Q15034 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
HERC3Q15034 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
HERC3Q15034 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HERC3Q15034 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HERC3Q15034 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HERC3Q15034 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HERC3Q15034 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HERC3Q15034 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HERC3Q15034 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HERC3Q15034 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HERC3Q15034 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HERC3Q15034 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HERC3Q15034 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HERC3Q15034 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HERC3Q15034 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HERC3Q15034 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HERC3Q15034 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HERC3Q15034 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HERC3Q15034 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HERC3Q15034 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HERC3Q15034 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HERC3Q15034 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HERC3Q15034 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HERC3Q15034 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HERC3Q15034 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HERC3Q15034 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HERC3Q15034 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HERC3Q15034 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HERC3Q15034 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HERC3Q15034 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HERC3Q15034 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HERC3Q15034 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HERC3Q15034 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HERC3Q15034 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HERC3Q15034 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HERC3Q15034 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HERC3Q15034 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HERC3Q15034 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HERC3Q15034 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HERC3Q15034 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HERC3Q15034 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HERC3Q15034 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
HERC3Q15034 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HERC3Q15034 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HERC3Q15034 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HERC3Q15034 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HERC3Q15034 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HERC3Q15034 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HERC3Q15034 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
HERC3Q15034 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HERC3Q15034 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HERC3Q15034 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HERC3Q15034 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HERC3Q15034 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HERC3Q15034 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
HERC3Q15034 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HERC3Q15034 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HERC3Q15034 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
HERC3Q15034 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HERC3Q15034 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HERC3Q15034 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HERC3Q15034 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HERC3Q15034 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HERC3Q15034 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HERC3Q15034 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HERC3Q15034 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HERC3Q15034 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HERC3Q15034 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HERC3Q15034 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HERC3Q15034 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HERC3Q15034 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HERC3Q15034 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HERC3Q15034 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HERC3Q15034 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HERC3Q15034 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HERC3Q15034 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HERC3Q15034 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HERC3Q15034 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HERC3Q15034 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HERC3Q15034 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HERC3Q15034 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HERC3Q15034 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HERC3Q15034 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HERC3Q15034 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
HERC3Q15034 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HERC3Q15034 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HERC3Q15034 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
HERC3Q15034 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HERC3Q15034 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HERC3Q15034 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HERC3Q15034 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HERC3Q15034 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HERC3Q15034 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HERC3Q15034 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HERC3Q15034 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HERC3Q15034 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HERC3Q15034 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
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