Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RFTN1Q14699 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
RFTN1Q14699 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RFTN1Q14699 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RFTN1Q14699 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RFTN1Q14699 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
RFTN1Q14699 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RFTN1Q14699 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RFTN1Q14699 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RFTN1Q14699 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RFTN1Q14699 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RFTN1Q14699 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RFTN1Q14699 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RFTN1Q14699 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RFTN1Q14699 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RFTN1Q14699 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RFTN1Q14699 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RFTN1Q14699 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RFTN1Q14699 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RFTN1Q14699 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RFTN1Q14699 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RFTN1Q14699 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RFTN1Q14699 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RFTN1Q14699 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RFTN1Q14699 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RFTN1Q14699 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RFTN1Q14699 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RFTN1Q14699 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RFTN1Q14699 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RFTN1Q14699 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RFTN1Q14699 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RFTN1Q14699 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
RFTN1Q14699 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RFTN1Q14699 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
RFTN1Q14699 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RFTN1Q14699 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RFTN1Q14699 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RFTN1Q14699 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
RFTN1Q14699 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RFTN1Q14699 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RFTN1Q14699 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RFTN1Q14699 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RFTN1Q14699 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RFTN1Q14699 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RFTN1Q14699 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RFTN1Q14699 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
RFTN1Q14699 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RFTN1Q14699 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RFTN1Q14699 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RFTN1Q14699 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
RFTN1Q14699 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RFTN1Q14699 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RFTN1Q14699 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RFTN1Q14699 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RFTN1Q14699 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RFTN1Q14699 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RFTN1Q14699 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RFTN1Q14699 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RFTN1Q14699 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RFTN1Q14699 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RFTN1Q14699 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RFTN1Q14699 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RFTN1Q14699 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RFTN1Q14699 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RFTN1Q14699 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RFTN1Q14699 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RFTN1Q14699 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
RFTN1Q14699 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RFTN1Q14699 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RFTN1Q14699 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RFTN1Q14699 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RFTN1Q14699 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RFTN1Q14699 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RFTN1Q14699 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RFTN1Q14699 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RFTN1Q14699 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
RFTN1Q14699 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RFTN1Q14699 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RFTN1Q14699 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
RFTN1Q14699 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RFTN1Q14699 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RFTN1Q14699 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RFTN1Q14699 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RFTN1Q14699 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
RFTN1Q14699 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RFTN1Q14699 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RFTN1Q14699 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RFTN1Q14699 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RFTN1Q14699 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RFTN1Q14699 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RFTN1Q14699 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RFTN1Q14699 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RFTN1Q14699 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
RFTN1Q14699 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RFTN1Q14699 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RFTN1Q14699 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
RFTN1Q14699 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RFTN1Q14699 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RFTN1Q14699 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RFTN1Q14699 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
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