Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIM25Q14258 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM25Q14258 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM25Q14258 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM25Q14258 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM25Q14258 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM25Q14258 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM25Q14258 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM25Q14258 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM25Q14258 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM25Q14258 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM25Q14258 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM25Q14258 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM25Q14258 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM25Q14258 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIM25Q14258 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIM25Q14258 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIM25Q14258 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIM25Q14258 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIM25Q14258 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIM25Q14258 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIM25Q14258 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIM25Q14258 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIM25Q14258 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TRIM25Q14258 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TRIM25Q14258 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRIM25Q14258 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRIM25Q14258 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRIM25Q14258 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRIM25Q14258 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRIM25Q14258 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRIM25Q14258 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM25Q14258 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM25Q14258 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM25Q14258 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM25Q14258 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM25Q14258 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM25Q14258 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM25Q14258 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM25Q14258 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM25Q14258 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM25Q14258 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM25Q14258 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM25Q14258 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM25Q14258 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM25Q14258 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM25Q14258 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM25Q14258 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM25Q14258 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM25Q14258 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM25Q14258 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM25Q14258 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM25Q14258 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM25Q14258 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM25Q14258 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM25Q14258 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM25Q14258 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM25Q14258 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM25Q14258 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM25Q14258 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM25Q14258 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM25Q14258 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM25Q14258 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM25Q14258 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM25Q14258 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM25Q14258 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM25Q14258 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM25Q14258 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM25Q14258 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM25Q14258 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM25Q14258 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM25Q14258 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM25Q14258 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM25Q14258 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM25Q14258 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM25Q14258 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM25Q14258 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM25Q14258 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM25Q14258 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM25Q14258 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM25Q14258 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRIM25Q14258 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRIM25Q14258 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRIM25Q14258 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRIM25Q14258 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRIM25Q14258 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRIM25Q14258 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRIM25Q14258 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRIM25Q14258 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TRIM25Q14258 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TRIM25Q14258 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TRIM25Q14258 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIM25Q14258 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIM25Q14258 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIM25Q14258 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIM25Q14258 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIM25Q14258 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIM25Q14258 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIM25Q14258 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIM25Q14258 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
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