Protein–RNA interactions for Protein: Q14126

DSG2, Desmoglein-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG2Q14126 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DSG2Q14126 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DSG2Q14126 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DSG2Q14126 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DSG2Q14126 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
DSG2Q14126 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
DSG2Q14126 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DSG2Q14126 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DSG2Q14126 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DSG2Q14126 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DSG2Q14126 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DSG2Q14126 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DSG2Q14126 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DSG2Q14126 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DSG2Q14126 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DSG2Q14126 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DSG2Q14126 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DSG2Q14126 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DSG2Q14126 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
DSG2Q14126 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
DSG2Q14126 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DSG2Q14126 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DSG2Q14126 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DSG2Q14126 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DSG2Q14126 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DSG2Q14126 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DSG2Q14126 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DSG2Q14126 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
DSG2Q14126 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DSG2Q14126 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
DSG2Q14126 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DSG2Q14126 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
DSG2Q14126 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
DSG2Q14126 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
DSG2Q14126 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DSG2Q14126 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
DSG2Q14126 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
DSG2Q14126 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DSG2Q14126 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
DSG2Q14126 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DSG2Q14126 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DSG2Q14126 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DSG2Q14126 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DSG2Q14126 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DSG2Q14126 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
DSG2Q14126 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
DSG2Q14126 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
DSG2Q14126 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
DSG2Q14126 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DSG2Q14126 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
DSG2Q14126 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
DSG2Q14126 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DSG2Q14126 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DSG2Q14126 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DSG2Q14126 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DSG2Q14126 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DSG2Q14126 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DSG2Q14126 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DSG2Q14126 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DSG2Q14126 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
DSG2Q14126 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
DSG2Q14126 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DSG2Q14126 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
DSG2Q14126 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
DSG2Q14126 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
DSG2Q14126 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
DSG2Q14126 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
DSG2Q14126 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DSG2Q14126 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DSG2Q14126 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
DSG2Q14126 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DSG2Q14126 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DSG2Q14126 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DSG2Q14126 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DSG2Q14126 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DSG2Q14126 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DSG2Q14126 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DSG2Q14126 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DSG2Q14126 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DSG2Q14126 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DSG2Q14126 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DSG2Q14126 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DSG2Q14126 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DSG2Q14126 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DSG2Q14126 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
DSG2Q14126 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DSG2Q14126 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DSG2Q14126 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DSG2Q14126 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DSG2Q14126 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DSG2Q14126 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DSG2Q14126 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DSG2Q14126 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DSG2Q14126 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DSG2Q14126 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DSG2Q14126 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DSG2Q14126 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DSG2Q14126 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DSG2Q14126 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DSG2Q14126 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.5 ms