Protein–RNA interactions for Protein: Q14011

CIRBP, Cold-inducible RNA-binding protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIRBPQ14011 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CIRBPQ14011 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CIRBPQ14011 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CIRBPQ14011 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CIRBPQ14011 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CIRBPQ14011 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CIRBPQ14011 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CIRBPQ14011 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CIRBPQ14011 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CIRBPQ14011 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CIRBPQ14011 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CIRBPQ14011 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CIRBPQ14011 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CIRBPQ14011 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CIRBPQ14011 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CIRBPQ14011 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CIRBPQ14011 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CIRBPQ14011 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CIRBPQ14011 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CIRBPQ14011 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CIRBPQ14011 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CIRBPQ14011 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CIRBPQ14011 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CIRBPQ14011 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CIRBPQ14011 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CIRBPQ14011 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CIRBPQ14011 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CIRBPQ14011 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CIRBPQ14011 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CIRBPQ14011 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CIRBPQ14011 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CIRBPQ14011 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CIRBPQ14011 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CIRBPQ14011 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CIRBPQ14011 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CIRBPQ14011 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CIRBPQ14011 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CIRBPQ14011 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CIRBPQ14011 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CIRBPQ14011 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CIRBPQ14011 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CIRBPQ14011 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CIRBPQ14011 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CIRBPQ14011 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CIRBPQ14011 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CIRBPQ14011 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CIRBPQ14011 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CIRBPQ14011 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CIRBPQ14011 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CIRBPQ14011 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CIRBPQ14011 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CIRBPQ14011 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CIRBPQ14011 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CIRBPQ14011 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CIRBPQ14011 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CIRBPQ14011 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CIRBPQ14011 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CIRBPQ14011 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CIRBPQ14011 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CIRBPQ14011 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CIRBPQ14011 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CIRBPQ14011 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CIRBPQ14011 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CIRBPQ14011 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CIRBPQ14011 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CIRBPQ14011 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CIRBPQ14011 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CIRBPQ14011 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CIRBPQ14011 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CIRBPQ14011 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CIRBPQ14011 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CIRBPQ14011 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CIRBPQ14011 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CIRBPQ14011 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CIRBPQ14011 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CIRBPQ14011 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CIRBPQ14011 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CIRBPQ14011 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CIRBPQ14011 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CIRBPQ14011 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CIRBPQ14011 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CIRBPQ14011 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CIRBPQ14011 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CIRBPQ14011 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CIRBPQ14011 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CIRBPQ14011 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CIRBPQ14011 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CIRBPQ14011 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CIRBPQ14011 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CIRBPQ14011 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CIRBPQ14011 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CIRBPQ14011 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CIRBPQ14011 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CIRBPQ14011 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CIRBPQ14011 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CIRBPQ14011 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CIRBPQ14011 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CIRBPQ14011 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CIRBPQ14011 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CIRBPQ14011 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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