Protein–RNA interactions for Protein: Q13938

CAPS, Calcyphosin, humanhuman

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Length 189 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPSQ13938 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CAPSQ13938 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CAPSQ13938 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CAPSQ13938 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CAPSQ13938 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CAPSQ13938 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CAPSQ13938 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CAPSQ13938 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CAPSQ13938 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CAPSQ13938 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CAPSQ13938 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CAPSQ13938 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CAPSQ13938 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CAPSQ13938 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CAPSQ13938 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CAPSQ13938 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CAPSQ13938 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CAPSQ13938 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CAPSQ13938 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CAPSQ13938 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CAPSQ13938 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CAPSQ13938 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CAPSQ13938 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CAPSQ13938 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CAPSQ13938 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CAPSQ13938 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CAPSQ13938 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CAPSQ13938 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CAPSQ13938 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CAPSQ13938 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CAPSQ13938 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CAPSQ13938 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CAPSQ13938 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CAPSQ13938 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CAPSQ13938 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CAPSQ13938 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CAPSQ13938 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CAPSQ13938 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CAPSQ13938 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CAPSQ13938 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CAPSQ13938 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CAPSQ13938 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CAPSQ13938 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CAPSQ13938 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CAPSQ13938 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CAPSQ13938 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CAPSQ13938 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CAPSQ13938 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CAPSQ13938 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CAPSQ13938 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CAPSQ13938 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CAPSQ13938 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CAPSQ13938 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CAPSQ13938 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CAPSQ13938 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CAPSQ13938 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CAPSQ13938 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CAPSQ13938 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CAPSQ13938 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CAPSQ13938 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CAPSQ13938 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CAPSQ13938 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CAPSQ13938 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CAPSQ13938 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CAPSQ13938 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CAPSQ13938 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CAPSQ13938 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CAPSQ13938 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CAPSQ13938 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CAPSQ13938 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CAPSQ13938 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CAPSQ13938 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CAPSQ13938 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CAPSQ13938 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CAPSQ13938 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CAPSQ13938 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CAPSQ13938 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CAPSQ13938 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CAPSQ13938 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CAPSQ13938 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CAPSQ13938 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CAPSQ13938 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CAPSQ13938 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CAPSQ13938 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CAPSQ13938 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CAPSQ13938 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CAPSQ13938 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CAPSQ13938 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CAPSQ13938 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CAPSQ13938 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CAPSQ13938 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CAPSQ13938 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CAPSQ13938 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CAPSQ13938 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CAPSQ13938 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CAPSQ13938 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CAPSQ13938 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CAPSQ13938 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CAPSQ13938 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CAPSQ13938 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
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