Protein–RNA interactions for Protein: Q13888

GTF2H2, General transcription factor IIH subunit 2, humanhuman

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Length 395 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H2Q13888 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTF2H2Q13888 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTF2H2Q13888 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTF2H2Q13888 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTF2H2Q13888 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTF2H2Q13888 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTF2H2Q13888 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTF2H2Q13888 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
GTF2H2Q13888 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTF2H2Q13888 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTF2H2Q13888 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GTF2H2Q13888 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GTF2H2Q13888 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GTF2H2Q13888 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GTF2H2Q13888 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GTF2H2Q13888 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GTF2H2Q13888 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GTF2H2Q13888 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GTF2H2Q13888 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GTF2H2Q13888 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GTF2H2Q13888 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GTF2H2Q13888 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GTF2H2Q13888 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GTF2H2Q13888 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GTF2H2Q13888 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GTF2H2Q13888 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GTF2H2Q13888 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GTF2H2Q13888 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GTF2H2Q13888 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GTF2H2Q13888 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GTF2H2Q13888 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GTF2H2Q13888 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GTF2H2Q13888 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GTF2H2Q13888 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
GTF2H2Q13888 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
GTF2H2Q13888 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GTF2H2Q13888 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
GTF2H2Q13888 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GTF2H2Q13888 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GTF2H2Q13888 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GTF2H2Q13888 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GTF2H2Q13888 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GTF2H2Q13888 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GTF2H2Q13888 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GTF2H2Q13888 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
GTF2H2Q13888 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GTF2H2Q13888 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
GTF2H2Q13888 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GTF2H2Q13888 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GTF2H2Q13888 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GTF2H2Q13888 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GTF2H2Q13888 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GTF2H2Q13888 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GTF2H2Q13888 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GTF2H2Q13888 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GTF2H2Q13888 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GTF2H2Q13888 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GTF2H2Q13888 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GTF2H2Q13888 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GTF2H2Q13888 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GTF2H2Q13888 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GTF2H2Q13888 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GTF2H2Q13888 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GTF2H2Q13888 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GTF2H2Q13888 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GTF2H2Q13888 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GTF2H2Q13888 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GTF2H2Q13888 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GTF2H2Q13888 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GTF2H2Q13888 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GTF2H2Q13888 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GTF2H2Q13888 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GTF2H2Q13888 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GTF2H2Q13888 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF2H2Q13888 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF2H2Q13888 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF2H2Q13888 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF2H2Q13888 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF2H2Q13888 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF2H2Q13888 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF2H2Q13888 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF2H2Q13888 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF2H2Q13888 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF2H2Q13888 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF2H2Q13888 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF2H2Q13888 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF2H2Q13888 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF2H2Q13888 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF2H2Q13888 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF2H2Q13888 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF2H2Q13888 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF2H2Q13888 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF2H2Q13888 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF2H2Q13888 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF2H2Q13888 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF2H2Q13888 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF2H2Q13888 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF2H2Q13888 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTF2H2Q13888 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTF2H2Q13888 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
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