Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

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Length 534 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NAE1Q13564 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NAE1Q13564 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NAE1Q13564 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NAE1Q13564 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NAE1Q13564 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NAE1Q13564 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NAE1Q13564 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NAE1Q13564 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NAE1Q13564 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NAE1Q13564 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NAE1Q13564 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NAE1Q13564 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NAE1Q13564 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NAE1Q13564 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NAE1Q13564 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NAE1Q13564 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NAE1Q13564 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NAE1Q13564 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NAE1Q13564 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NAE1Q13564 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NAE1Q13564 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NAE1Q13564 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NAE1Q13564 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NAE1Q13564 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NAE1Q13564 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NAE1Q13564 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NAE1Q13564 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NAE1Q13564 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NAE1Q13564 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NAE1Q13564 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NAE1Q13564 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NAE1Q13564 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NAE1Q13564 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NAE1Q13564 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NAE1Q13564 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NAE1Q13564 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NAE1Q13564 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NAE1Q13564 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NAE1Q13564 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NAE1Q13564 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NAE1Q13564 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NAE1Q13564 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NAE1Q13564 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NAE1Q13564 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NAE1Q13564 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NAE1Q13564 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NAE1Q13564 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NAE1Q13564 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NAE1Q13564 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NAE1Q13564 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NAE1Q13564 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NAE1Q13564 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NAE1Q13564 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NAE1Q13564 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NAE1Q13564 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NAE1Q13564 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NAE1Q13564 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NAE1Q13564 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NAE1Q13564 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NAE1Q13564 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NAE1Q13564 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NAE1Q13564 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NAE1Q13564 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NAE1Q13564 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NAE1Q13564 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NAE1Q13564 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NAE1Q13564 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NAE1Q13564 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NAE1Q13564 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NAE1Q13564 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NAE1Q13564 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NAE1Q13564 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NAE1Q13564 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NAE1Q13564 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NAE1Q13564 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NAE1Q13564 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NAE1Q13564 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NAE1Q13564 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NAE1Q13564 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NAE1Q13564 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NAE1Q13564 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NAE1Q13564 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NAE1Q13564 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NAE1Q13564 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NAE1Q13564 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NAE1Q13564 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NAE1Q13564 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NAE1Q13564 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NAE1Q13564 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NAE1Q13564 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NAE1Q13564 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
NAE1Q13564 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NAE1Q13564 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NAE1Q13564 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NAE1Q13564 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
NAE1Q13564 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NAE1Q13564 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NAE1Q13564 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NAE1Q13564 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
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