Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
HDAC1Q13547 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
HDAC1Q13547 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
HDAC1Q13547 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
HDAC1Q13547 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
HDAC1Q13547 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
HDAC1Q13547 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
HDAC1Q13547 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
HDAC1Q13547 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
HDAC1Q13547 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
HDAC1Q13547 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
HDAC1Q13547 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
HDAC1Q13547 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
HDAC1Q13547 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
HDAC1Q13547 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
HDAC1Q13547 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
HDAC1Q13547 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
HDAC1Q13547 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
HDAC1Q13547 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
HDAC1Q13547 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
HDAC1Q13547 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
HDAC1Q13547 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
HDAC1Q13547 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
HDAC1Q13547 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
HDAC1Q13547 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
HDAC1Q13547 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
HDAC1Q13547 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
HDAC1Q13547 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
HDAC1Q13547 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
HDAC1Q13547 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
HDAC1Q13547 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
HDAC1Q13547 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
HDAC1Q13547 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
HDAC1Q13547 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
HDAC1Q13547 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
HDAC1Q13547 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
HDAC1Q13547 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
HDAC1Q13547 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
HDAC1Q13547 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
HDAC1Q13547 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
HDAC1Q13547 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
HDAC1Q13547 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
HDAC1Q13547 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
HDAC1Q13547 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
HDAC1Q13547 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
HDAC1Q13547 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
HDAC1Q13547 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
HDAC1Q13547 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
HDAC1Q13547 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
HDAC1Q13547 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
HDAC1Q13547 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
HDAC1Q13547 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
HDAC1Q13547 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
HDAC1Q13547 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
HDAC1Q13547 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
HDAC1Q13547 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
HDAC1Q13547 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
HDAC1Q13547 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
HDAC1Q13547 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
HDAC1Q13547 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
HDAC1Q13547 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
HDAC1Q13547 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
HDAC1Q13547 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
HDAC1Q13547 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
HDAC1Q13547 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
HDAC1Q13547 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
HDAC1Q13547 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
HDAC1Q13547 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
HDAC1Q13547 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
HDAC1Q13547 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
HDAC1Q13547 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
HDAC1Q13547 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
HDAC1Q13547 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
HDAC1Q13547 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
HDAC1Q13547 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
HDAC1Q13547 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
HDAC1Q13547 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
HDAC1Q13547 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
HDAC1Q13547 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
HDAC1Q13547 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
HDAC1Q13547 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
HDAC1Q13547 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
HDAC1Q13547 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
HDAC1Q13547 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
HDAC1Q13547 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
HDAC1Q13547 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
HDAC1Q13547 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
HDAC1Q13547 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
HDAC1Q13547 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
HDAC1Q13547 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
HDAC1Q13547 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
HDAC1Q13547 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
HDAC1Q13547 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
HDAC1Q13547 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
HDAC1Q13547 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
HDAC1Q13547 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
HDAC1Q13547 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
HDAC1Q13547 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
HDAC1Q13547 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
HDAC1Q13547 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
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