Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C1orf61Q13536 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C1orf61Q13536 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C1orf61Q13536 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C1orf61Q13536 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
C1orf61Q13536 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C1orf61Q13536 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C1orf61Q13536 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C1orf61Q13536 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C1orf61Q13536 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C1orf61Q13536 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C1orf61Q13536 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
C1orf61Q13536 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C1orf61Q13536 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C1orf61Q13536 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C1orf61Q13536 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C1orf61Q13536 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C1orf61Q13536 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C1orf61Q13536 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C1orf61Q13536 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C1orf61Q13536 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C1orf61Q13536 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C1orf61Q13536 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C1orf61Q13536 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C1orf61Q13536 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C1orf61Q13536 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C1orf61Q13536 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C1orf61Q13536 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
C1orf61Q13536 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C1orf61Q13536 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
C1orf61Q13536 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
C1orf61Q13536 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
C1orf61Q13536 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
C1orf61Q13536 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
C1orf61Q13536 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
C1orf61Q13536 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C1orf61Q13536 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C1orf61Q13536 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C1orf61Q13536 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C1orf61Q13536 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C1orf61Q13536 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C1orf61Q13536 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C1orf61Q13536 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
C1orf61Q13536 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C1orf61Q13536 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C1orf61Q13536 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
C1orf61Q13536 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
C1orf61Q13536 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
C1orf61Q13536 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
C1orf61Q13536 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
C1orf61Q13536 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
C1orf61Q13536 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C1orf61Q13536 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C1orf61Q13536 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C1orf61Q13536 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C1orf61Q13536 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C1orf61Q13536 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C1orf61Q13536 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C1orf61Q13536 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C1orf61Q13536 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C1orf61Q13536 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C1orf61Q13536 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C1orf61Q13536 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
C1orf61Q13536 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
C1orf61Q13536 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
C1orf61Q13536 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
C1orf61Q13536 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
C1orf61Q13536 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
C1orf61Q13536 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
C1orf61Q13536 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
C1orf61Q13536 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
C1orf61Q13536 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
C1orf61Q13536 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
C1orf61Q13536 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
C1orf61Q13536 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C1orf61Q13536 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C1orf61Q13536 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C1orf61Q13536 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
C1orf61Q13536 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C1orf61Q13536 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C1orf61Q13536 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C1orf61Q13536 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C1orf61Q13536 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C1orf61Q13536 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C1orf61Q13536 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C1orf61Q13536 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
C1orf61Q13536 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
C1orf61Q13536 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
C1orf61Q13536 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
C1orf61Q13536 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C1orf61Q13536 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C1orf61Q13536 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
C1orf61Q13536 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C1orf61Q13536 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C1orf61Q13536 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C1orf61Q13536 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C1orf61Q13536 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C1orf61Q13536 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C1orf61Q13536 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C1orf61Q13536 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
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