Protein–RNA interactions for Protein: Q13492

PICALM, Phosphatidylinositol-binding clathrin assembly protein, humanhuman

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Length 652 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PICALMQ13492 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PICALMQ13492 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PICALMQ13492 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
PICALMQ13492 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PICALMQ13492 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PICALMQ13492 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PICALMQ13492 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PICALMQ13492 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PICALMQ13492 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PICALMQ13492 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PICALMQ13492 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PICALMQ13492 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PICALMQ13492 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
PICALMQ13492 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PICALMQ13492 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PICALMQ13492 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PICALMQ13492 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PICALMQ13492 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PICALMQ13492 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PICALMQ13492 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PICALMQ13492 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PICALMQ13492 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PICALMQ13492 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PICALMQ13492 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PICALMQ13492 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PICALMQ13492 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PICALMQ13492 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PICALMQ13492 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PICALMQ13492 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PICALMQ13492 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
PICALMQ13492 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PICALMQ13492 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PICALMQ13492 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PICALMQ13492 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
PICALMQ13492 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PICALMQ13492 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PICALMQ13492 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PICALMQ13492 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
PICALMQ13492 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PICALMQ13492 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC27.57■■■□□ 2
PICALMQ13492 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PICALMQ13492 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC27.56■■■□□ 2
PICALMQ13492 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PICALMQ13492 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PICALMQ13492 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PICALMQ13492 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PICALMQ13492 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PICALMQ13492 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PICALMQ13492 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PICALMQ13492 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PICALMQ13492 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PICALMQ13492 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
PICALMQ13492 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
PICALMQ13492 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC27.54■■■□□ 2
PICALMQ13492 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PICALMQ13492 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PICALMQ13492 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PICALMQ13492 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PICALMQ13492 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC27.53■■■□□ 2
PICALMQ13492 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC27.53■■■□□ 2
PICALMQ13492 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PICALMQ13492 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PICALMQ13492 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
PICALMQ13492 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC27.52■■■□□ 2
PICALMQ13492 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
PICALMQ13492 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PICALMQ13492 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PICALMQ13492 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PICALMQ13492 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
PICALMQ13492 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PICALMQ13492 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
PICALMQ13492 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PICALMQ13492 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PICALMQ13492 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PICALMQ13492 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PICALMQ13492 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PICALMQ13492 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PICALMQ13492 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PICALMQ13492 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PICALMQ13492 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PICALMQ13492 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PICALMQ13492 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PICALMQ13492 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PICALMQ13492 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PICALMQ13492 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PICALMQ13492 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PICALMQ13492 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PICALMQ13492 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PICALMQ13492 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PICALMQ13492 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PICALMQ13492 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PICALMQ13492 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PICALMQ13492 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PICALMQ13492 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
PICALMQ13492 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PICALMQ13492 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PICALMQ13492 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PICALMQ13492 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PICALMQ13492 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PICALMQ13492 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
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