Protein–RNA interactions for Protein: Q13224

GRIN2B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, humanhuman

Predictions only

Length 1,484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2BQ13224 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
GRIN2BQ13224 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
GRIN2BQ13224 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
GRIN2BQ13224 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
GRIN2BQ13224 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC38.55■■■■□ 3.76
GRIN2BQ13224 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
GRIN2BQ13224 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
GRIN2BQ13224 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
GRIN2BQ13224 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC38.54■■■■□ 3.76
GRIN2BQ13224 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC38.54■■■■□ 3.76
GRIN2BQ13224 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
GRIN2BQ13224 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
GRIN2BQ13224 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
GRIN2BQ13224 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC38.52■■■■□ 3.76
GRIN2BQ13224 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC38.52■■■■□ 3.76
GRIN2BQ13224 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC38.52■■■■□ 3.76
GRIN2BQ13224 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
GRIN2BQ13224 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
GRIN2BQ13224 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC38.51■■■■□ 3.76
GRIN2BQ13224 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC38.51■■■■□ 3.76
GRIN2BQ13224 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
GRIN2BQ13224 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.75
GRIN2BQ13224 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.75
GRIN2BQ13224 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.75
GRIN2BQ13224 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
GRIN2BQ13224 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC38.5■■■■□ 3.75
GRIN2BQ13224 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC38.5■■■■□ 3.75
GRIN2BQ13224 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC38.5■■■■□ 3.75
GRIN2BQ13224 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
GRIN2BQ13224 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
GRIN2BQ13224 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC38.49■■■■□ 3.75
GRIN2BQ13224 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
GRIN2BQ13224 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
GRIN2BQ13224 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
GRIN2BQ13224 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC38.48■■■■□ 3.75
GRIN2BQ13224 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC38.48■■■■□ 3.75
GRIN2BQ13224 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
GRIN2BQ13224 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
GRIN2BQ13224 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC38.47■■■■□ 3.75
GRIN2BQ13224 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC38.47■■■■□ 3.75
GRIN2BQ13224 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC38.47■■■■□ 3.75
GRIN2BQ13224 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
GRIN2BQ13224 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
GRIN2BQ13224 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC38.47■■■■□ 3.75
GRIN2BQ13224 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
GRIN2BQ13224 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.46■■■■□ 3.75
GRIN2BQ13224 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
GRIN2BQ13224 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC38.46■■■■□ 3.75
GRIN2BQ13224 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC38.46■■■■□ 3.75
GRIN2BQ13224 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
GRIN2BQ13224 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.45■■■■□ 3.75
GRIN2BQ13224 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
GRIN2BQ13224 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
GRIN2BQ13224 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC38.45■■■■□ 3.75
GRIN2BQ13224 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC38.45■■■■□ 3.75
GRIN2BQ13224 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC38.45■■■■□ 3.75
GRIN2BQ13224 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC38.45■■■■□ 3.75
GRIN2BQ13224 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC38.45■■■■□ 3.75
GRIN2BQ13224 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC38.45■■■■□ 3.75
GRIN2BQ13224 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC38.45■■■■□ 3.75
GRIN2BQ13224 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC38.45■■■■□ 3.75
GRIN2BQ13224 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC38.45■■■■□ 3.75
GRIN2BQ13224 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC38.45■■■■□ 3.75
GRIN2BQ13224 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.74
GRIN2BQ13224 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
GRIN2BQ13224 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
GRIN2BQ13224 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
GRIN2BQ13224 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
GRIN2BQ13224 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
GRIN2BQ13224 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.44■■■■□ 3.74
GRIN2BQ13224 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
GRIN2BQ13224 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
GRIN2BQ13224 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC38.43■■■■□ 3.74
GRIN2BQ13224 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC38.43■■■■□ 3.74
GRIN2BQ13224 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC38.43■■■■□ 3.74
GRIN2BQ13224 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
GRIN2BQ13224 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC38.43■■■■□ 3.74
GRIN2BQ13224 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC38.43■■■■□ 3.74
GRIN2BQ13224 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.43■■■■□ 3.74
GRIN2BQ13224 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.43■■■■□ 3.74
GRIN2BQ13224 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC38.43■■■■□ 3.74
GRIN2BQ13224 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC38.43■■■■□ 3.74
GRIN2BQ13224 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
GRIN2BQ13224 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC38.42■■■■□ 3.74
GRIN2BQ13224 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC38.42■■■■□ 3.74
GRIN2BQ13224 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC38.42■■■■□ 3.74
GRIN2BQ13224 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
GRIN2BQ13224 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC38.42■■■■□ 3.74
GRIN2BQ13224 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
GRIN2BQ13224 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
GRIN2BQ13224 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC38.41■■■■□ 3.74
GRIN2BQ13224 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
GRIN2BQ13224 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC38.41■■■■□ 3.74
GRIN2BQ13224 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
GRIN2BQ13224 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
GRIN2BQ13224 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
GRIN2BQ13224 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
GRIN2BQ13224 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC38.41■■■■□ 3.74
GRIN2BQ13224 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
GRIN2BQ13224 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC38.4■■■■□ 3.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms