Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KCNMA1Q12791 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KCNMA1Q12791 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KCNMA1Q12791 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
KCNMA1Q12791 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KCNMA1Q12791 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KCNMA1Q12791 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KCNMA1Q12791 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KCNMA1Q12791 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KCNMA1Q12791 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KCNMA1Q12791 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KCNMA1Q12791 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KCNMA1Q12791 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KCNMA1Q12791 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KCNMA1Q12791 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KCNMA1Q12791 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KCNMA1Q12791 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KCNMA1Q12791 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KCNMA1Q12791 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KCNMA1Q12791 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KCNMA1Q12791 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KCNMA1Q12791 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KCNMA1Q12791 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KCNMA1Q12791 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KCNMA1Q12791 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KCNMA1Q12791 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KCNMA1Q12791 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KCNMA1Q12791 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KCNMA1Q12791 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KCNMA1Q12791 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KCNMA1Q12791 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KCNMA1Q12791 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KCNMA1Q12791 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KCNMA1Q12791 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KCNMA1Q12791 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KCNMA1Q12791 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KCNMA1Q12791 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KCNMA1Q12791 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KCNMA1Q12791 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KCNMA1Q12791 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KCNMA1Q12791 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KCNMA1Q12791 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KCNMA1Q12791 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KCNMA1Q12791 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KCNMA1Q12791 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KCNMA1Q12791 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KCNMA1Q12791 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KCNMA1Q12791 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KCNMA1Q12791 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KCNMA1Q12791 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KCNMA1Q12791 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KCNMA1Q12791 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KCNMA1Q12791 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
KCNMA1Q12791 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
KCNMA1Q12791 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KCNMA1Q12791 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
KCNMA1Q12791 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KCNMA1Q12791 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
KCNMA1Q12791 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KCNMA1Q12791 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KCNMA1Q12791 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KCNMA1Q12791 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KCNMA1Q12791 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KCNMA1Q12791 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KCNMA1Q12791 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KCNMA1Q12791 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KCNMA1Q12791 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KCNMA1Q12791 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
KCNMA1Q12791 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KCNMA1Q12791 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KCNMA1Q12791 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KCNMA1Q12791 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KCNMA1Q12791 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KCNMA1Q12791 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KCNMA1Q12791 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KCNMA1Q12791 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KCNMA1Q12791 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KCNMA1Q12791 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KCNMA1Q12791 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KCNMA1Q12791 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KCNMA1Q12791 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KCNMA1Q12791 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KCNMA1Q12791 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KCNMA1Q12791 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KCNMA1Q12791 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
KCNMA1Q12791 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
KCNMA1Q12791 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KCNMA1Q12791 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KCNMA1Q12791 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KCNMA1Q12791 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
KCNMA1Q12791 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KCNMA1Q12791 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KCNMA1Q12791 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KCNMA1Q12791 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KCNMA1Q12791 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KCNMA1Q12791 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KCNMA1Q12791 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KCNMA1Q12791 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
KCNMA1Q12791 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
KCNMA1Q12791 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
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