Protein–RNA interactions for Protein: Q12770

SCAP, Sterol regulatory element-binding protein cleavage-activating protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,279 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPQ12770 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCAPQ12770 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCAPQ12770 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCAPQ12770 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCAPQ12770 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCAPQ12770 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCAPQ12770 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SCAPQ12770 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SCAPQ12770 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCAPQ12770 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCAPQ12770 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCAPQ12770 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCAPQ12770 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCAPQ12770 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCAPQ12770 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCAPQ12770 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCAPQ12770 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCAPQ12770 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCAPQ12770 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCAPQ12770 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCAPQ12770 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCAPQ12770 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCAPQ12770 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SCAPQ12770 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SCAPQ12770 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SCAPQ12770 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SCAPQ12770 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SCAPQ12770 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SCAPQ12770 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SCAPQ12770 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SCAPQ12770 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCAPQ12770 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCAPQ12770 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCAPQ12770 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCAPQ12770 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCAPQ12770 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCAPQ12770 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCAPQ12770 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCAPQ12770 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCAPQ12770 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SCAPQ12770 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCAPQ12770 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCAPQ12770 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCAPQ12770 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCAPQ12770 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCAPQ12770 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCAPQ12770 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCAPQ12770 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCAPQ12770 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCAPQ12770 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCAPQ12770 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCAPQ12770 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCAPQ12770 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SCAPQ12770 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCAPQ12770 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCAPQ12770 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCAPQ12770 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCAPQ12770 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCAPQ12770 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCAPQ12770 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCAPQ12770 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCAPQ12770 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCAPQ12770 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCAPQ12770 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCAPQ12770 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCAPQ12770 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCAPQ12770 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCAPQ12770 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCAPQ12770 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCAPQ12770 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCAPQ12770 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCAPQ12770 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCAPQ12770 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCAPQ12770 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCAPQ12770 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SCAPQ12770 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCAPQ12770 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCAPQ12770 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCAPQ12770 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SCAPQ12770 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SCAPQ12770 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SCAPQ12770 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SCAPQ12770 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SCAPQ12770 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SCAPQ12770 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SCAPQ12770 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SCAPQ12770 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SCAPQ12770 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SCAPQ12770 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SCAPQ12770 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SCAPQ12770 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SCAPQ12770 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SCAPQ12770 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SCAPQ12770 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SCAPQ12770 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SCAPQ12770 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SCAPQ12770 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SCAPQ12770 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCAPQ12770 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SCAPQ12770 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
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