Protein–RNA interactions for Protein: Q12060

HFI1, Transcriptional coactivator HFI1/ADA1, yeastyeast

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HFI1Q12060 VPS5YOR069W 2028 nt5.91□□□□□ -1.46
HFI1Q12060 GUP2YPL189W 1830 nt5.91□□□□□ -1.46
HFI1Q12060 YER134CYER134C 537 nt5.91□□□□□ -1.46
HFI1Q12060 YIL077CYIL077C 963 nt5.91□□□□□ -1.46
HFI1Q12060 YJR056CYJR056C 711 nt5.91□□□□□ -1.46
HFI1Q12060 KTR3YBR205W 1215 nt5.91□□□□□ -1.46
HFI1Q12060 YEL020CYEL020C 1683 nt5.91□□□□□ -1.46
HFI1Q12060 NOB1YOR056C 1380 nt5.91□□□□□ -1.46
HFI1Q12060 TEF1YPR080W 1377 nt5.91□□□□□ -1.46
HFI1Q12060 TEF2YBR118W 1377 nt5.91□□□□□ -1.46
HFI1Q12060 HXT7YDR342C 1713 nt5.91□□□□□ -1.46
HFI1Q12060 HXT6YDR343C 1713 nt5.91□□□□□ -1.46
HFI1Q12060 IMA2YOL157C 1770 nt5.9□□□□□ -1.46
HFI1Q12060 RSA4YCR072C 1548 nt5.9□□□□□ -1.46
HFI1Q12060 PCS60YBR222C 1632 nt5.9□□□□□ -1.46
HFI1Q12060 IPK1YDR315C 846 nt5.9□□□□□ -1.46
HFI1Q12060 YHL045WYHL045W 348 nt5.9□□□□□ -1.46
HFI1Q12060 GTR1YML121W 933 nt5.9□□□□□ -1.46
HFI1Q12060 YMR075C-AYMR075C-A 366 nt5.9□□□□□ -1.46
HFI1Q12060 YOR318CYOR318C 306 nt5.9□□□□□ -1.46
HFI1Q12060 SUI3YPL237W 858 nt5.9□□□□□ -1.46
HFI1Q12060 FHL1YPR104C 2811 nt5.89□□□□□ -1.47
HFI1Q12060 MOB2YFL034C-B 864 nt5.89□□□□□ -1.47
HFI1Q12060 YGR273CYGR273C 525 nt5.89□□□□□ -1.47
HFI1Q12060 SCW4YGR279C 1161 nt5.89□□□□□ -1.47
HFI1Q12060 SAM4YPL273W 978 nt5.89□□□□□ -1.47
HFI1Q12060 GEX2YKR106W 1848 nt5.89□□□□□ -1.47
HFI1Q12060 MAL13YGR288W 1422 nt5.89□□□□□ -1.47
HFI1Q12060 ACS1YAL054C 2142 nt5.89□□□□□ -1.47
HFI1Q12060 GET3YDL100C 1065 nt5.88□□□□□ -1.47
HFI1Q12060 SAY1YGR263C 1275 nt5.88□□□□□ -1.47
HFI1Q12060 ARD1YHR013C 717 nt5.88□□□□□ -1.47
HFI1Q12060 UIP3YAR027W 708 nt5.88□□□□□ -1.47
HFI1Q12060 VPS28YPL065W 729 nt5.88□□□□□ -1.47
HFI1Q12060 PDB1YBR221C 1101 nt5.88□□□□□ -1.47
HFI1Q12060 STL1YDR536W 1710 nt5.88□□□□□ -1.47
HFI1Q12060 MMP1YLL061W 1752 nt5.88□□□□□ -1.47
HFI1Q12060 SNT2YGL131C 4212 nt5.88□□□□□ -1.47
HFI1Q12060 STE12YHR084W 2067 nt5.87□□□□□ -1.47
HFI1Q12060 TFG1YGR186W 2208 nt5.87□□□□□ -1.47
HFI1Q12060 RMD1YDL001W 1293 nt5.87□□□□□ -1.47
HFI1Q12060 MHO1YJR008W 1017 nt5.87□□□□□ -1.47
HFI1Q12060 YPR195CYPR195C 330 nt5.87□□□□□ -1.47
HFI1Q12060 YEH1YLL012W 1722 nt5.87□□□□□ -1.47
HFI1Q12060 TRP5YGL026C 2124 nt5.87□□□□□ -1.47
HFI1Q12060 GSH2YOL049W 1476 nt5.86□□□□□ -1.47
HFI1Q12060 IDP1YDL066W 1287 nt5.86□□□□□ -1.47
HFI1Q12060 YDR249CYDR249C 1122 nt5.86□□□□□ -1.47
HFI1Q12060 ASP1YDR321W 1146 nt5.86□□□□□ -1.47
HFI1Q12060 BLS1YLR408C 369 nt5.86□□□□□ -1.47
HFI1Q12060 PSH1YOL054W 1221 nt5.86□□□□□ -1.47
HFI1Q12060 YOR020W-AYOR020W-A 273 nt5.86□□□□□ -1.47
HFI1Q12060 MRC1YCL061C 3291 nt5.86□□□□□ -1.47
HFI1Q12060 PRT1YOR361C 2292 nt5.86□□□□□ -1.47
HFI1Q12060 ESC8YOL017W 2145 nt5.86□□□□□ -1.47
HFI1Q12060 NDC1YML031W 1968 nt5.86□□□□□ -1.47
HFI1Q12060 ACC1YNR016C 6702 nt5.85□□□□□ -1.47
HFI1Q12060 RPL7AYGL076C 735 nt5.85□□□□□ -1.47
HFI1Q12060 RPL7BYPL198W 735 nt5.85□□□□□ -1.47
HFI1Q12060 ISA2YPR067W 558 nt5.85□□□□□ -1.47
HFI1Q12060 YFL042CYFL042C 2025 nt5.85□□□□□ -1.47
HFI1Q12060 GEP3YOR205C 1671 nt5.85□□□□□ -1.47
HFI1Q12060 SMF3YLR034C 1422 nt5.84□□□□□ -1.47
HFI1Q12060 KEL1YHR158C 3495 nt5.84□□□□□ -1.47
HFI1Q12060 SPO16YHR153C 597 nt5.84□□□□□ -1.47
HFI1Q12060 POM33YLL023C 840 nt5.84□□□□□ -1.47
HFI1Q12060 MRL1YPR079W 1146 nt5.84□□□□□ -1.47
HFI1Q12060 UBC4YBR082C 447 nt5.84□□□□□ -1.47
HFI1Q12060 VHT1YGR065C 1782 nt5.84□□□□□ -1.47
HFI1Q12060 PHO8YDR481C 1701 nt5.84□□□□□ -1.47
HFI1Q12060 ATP1YBL099W 1638 nt5.84□□□□□ -1.47
HFI1Q12060 RMD9YGL107C 1941 nt5.84□□□□□ -1.48
HFI1Q12060 DUG1YFR044C 1446 nt5.83□□□□□ -1.48
HFI1Q12060 YNG2YHR090C 849 nt5.83□□□□□ -1.48
HFI1Q12060 RPS31YLR167W 459 nt5.83□□□□□ -1.48
HFI1Q12060 ATG1YGL180W 2694 nt5.83□□□□□ -1.48
HFI1Q12060 TOS4YLR183C 1470 nt5.83□□□□□ -1.48
HFI1Q12060 PAT1YCR077C 2391 nt5.82□□□□□ -1.48
HFI1Q12060 HOS1YPR068C 1413 nt5.82□□□□□ -1.48
HFI1Q12060 UTP7YER082C 1665 nt5.82□□□□□ -1.48
HFI1Q12060 YHR045WYHR045W 1683 nt5.82□□□□□ -1.48
HFI1Q12060 DPH2YKL191W 1605 nt5.82□□□□□ -1.48
HFI1Q12060 SUB2YDL084W 1341 nt5.82□□□□□ -1.48
HFI1Q12060 YPK3YBR028C 1578 nt5.82□□□□□ -1.48
HFI1Q12060 SCL1YGL011C 759 nt5.82□□□□□ -1.48
HFI1Q12060 ATP14YLR295C 375 nt5.82□□□□□ -1.48
HFI1Q12060 YPL062WYPL062W 405 nt5.82□□□□□ -1.48
HFI1Q12060 PYC1YGL062W 3537 nt5.82□□□□□ -1.48
HFI1Q12060 GRX6YDL010W 696 nt5.81□□□□□ -1.48
HFI1Q12060 ARP1YHR129C 1155 nt5.81□□□□□ -1.48
HFI1Q12060 CBF1YJR060W 1056 nt5.81□□□□□ -1.48
HFI1Q12060 MRT4YKL009W 711 nt5.81□□□□□ -1.48
HFI1Q12060 YMR086C-AYMR086C-A 339 nt5.81□□□□□ -1.48
HFI1Q12060 CLB2YPR119W 1476 nt5.81□□□□□ -1.48
HFI1Q12060 SKN1YGR143W 2316 nt5.8□□□□□ -1.48
HFI1Q12060 YJR124CYJR124C 1347 nt5.79□□□□□ -1.48
HFI1Q12060 CLB5YPR120C 1308 nt5.79□□□□□ -1.48
HFI1Q12060 TAX4YJL083W 1815 nt5.79□□□□□ -1.48
HFI1Q12060 RRP45YDR280W 918 nt5.79□□□□□ -1.48
HFI1Q12060 tR(ACG)JtR(ACG)J 73 nt5.79□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 13.5 ms