Protein–RNA interactions for Protein: Q0VFZ6

CCDC173, Coiled-coil domain-containing protein 173, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC173Q0VFZ6 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC173Q0VFZ6 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC173Q0VFZ6 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC173Q0VFZ6 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC173Q0VFZ6 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC173Q0VFZ6 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC173Q0VFZ6 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC173Q0VFZ6 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC173Q0VFZ6 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC173Q0VFZ6 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC173Q0VFZ6 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC173Q0VFZ6 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC173Q0VFZ6 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC173Q0VFZ6 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC173Q0VFZ6 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC173Q0VFZ6 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC173Q0VFZ6 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC173Q0VFZ6 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC173Q0VFZ6 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC173Q0VFZ6 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC173Q0VFZ6 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC173Q0VFZ6 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC173Q0VFZ6 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC173Q0VFZ6 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC173Q0VFZ6 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC173Q0VFZ6 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC173Q0VFZ6 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC173Q0VFZ6 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC173Q0VFZ6 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC173Q0VFZ6 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC173Q0VFZ6 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC173Q0VFZ6 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC173Q0VFZ6 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC173Q0VFZ6 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC173Q0VFZ6 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC173Q0VFZ6 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC173Q0VFZ6 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC173Q0VFZ6 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC173Q0VFZ6 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC173Q0VFZ6 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC173Q0VFZ6 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC173Q0VFZ6 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC173Q0VFZ6 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC173Q0VFZ6 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC173Q0VFZ6 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC173Q0VFZ6 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC173Q0VFZ6 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC173Q0VFZ6 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC173Q0VFZ6 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC173Q0VFZ6 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC173Q0VFZ6 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC173Q0VFZ6 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC173Q0VFZ6 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC173Q0VFZ6 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
CCDC173Q0VFZ6 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC173Q0VFZ6 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC173Q0VFZ6 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC173Q0VFZ6 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC173Q0VFZ6 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC173Q0VFZ6 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC173Q0VFZ6 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC173Q0VFZ6 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC173Q0VFZ6 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC173Q0VFZ6 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC173Q0VFZ6 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC173Q0VFZ6 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC173Q0VFZ6 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC173Q0VFZ6 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC173Q0VFZ6 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC173Q0VFZ6 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC173Q0VFZ6 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC173Q0VFZ6 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC173Q0VFZ6 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC173Q0VFZ6 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC173Q0VFZ6 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC173Q0VFZ6 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC173Q0VFZ6 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC173Q0VFZ6 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC173Q0VFZ6 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC173Q0VFZ6 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC173Q0VFZ6 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC173Q0VFZ6 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC173Q0VFZ6 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC173Q0VFZ6 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC173Q0VFZ6 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC173Q0VFZ6 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC173Q0VFZ6 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC173Q0VFZ6 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC173Q0VFZ6 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC173Q0VFZ6 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC173Q0VFZ6 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC173Q0VFZ6 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC173Q0VFZ6 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC173Q0VFZ6 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC173Q0VFZ6 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC173Q0VFZ6 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC173Q0VFZ6 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC173Q0VFZ6 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC173Q0VFZ6 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC173Q0VFZ6 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms