Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PDE4DQ08499 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PDE4DQ08499 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PDE4DQ08499 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PDE4DQ08499 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PDE4DQ08499 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PDE4DQ08499 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PDE4DQ08499 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
PDE4DQ08499 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PDE4DQ08499 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PDE4DQ08499 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PDE4DQ08499 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PDE4DQ08499 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PDE4DQ08499 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PDE4DQ08499 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PDE4DQ08499 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PDE4DQ08499 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PDE4DQ08499 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
PDE4DQ08499 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PDE4DQ08499 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PDE4DQ08499 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PDE4DQ08499 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PDE4DQ08499 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PDE4DQ08499 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PDE4DQ08499 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PDE4DQ08499 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PDE4DQ08499 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
PDE4DQ08499 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PDE4DQ08499 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PDE4DQ08499 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PDE4DQ08499 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PDE4DQ08499 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PDE4DQ08499 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PDE4DQ08499 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PDE4DQ08499 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
PDE4DQ08499 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PDE4DQ08499 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PDE4DQ08499 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PDE4DQ08499 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PDE4DQ08499 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PDE4DQ08499 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PDE4DQ08499 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PDE4DQ08499 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PDE4DQ08499 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PDE4DQ08499 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PDE4DQ08499 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PDE4DQ08499 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PDE4DQ08499 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PDE4DQ08499 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PDE4DQ08499 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PDE4DQ08499 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PDE4DQ08499 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PDE4DQ08499 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PDE4DQ08499 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PDE4DQ08499 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PDE4DQ08499 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PDE4DQ08499 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PDE4DQ08499 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PDE4DQ08499 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PDE4DQ08499 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PDE4DQ08499 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
PDE4DQ08499 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PDE4DQ08499 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PDE4DQ08499 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
PDE4DQ08499 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PDE4DQ08499 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PDE4DQ08499 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PDE4DQ08499 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PDE4DQ08499 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PDE4DQ08499 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PDE4DQ08499 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PDE4DQ08499 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PDE4DQ08499 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
PDE4DQ08499 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PDE4DQ08499 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PDE4DQ08499 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
PDE4DQ08499 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PDE4DQ08499 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PDE4DQ08499 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PDE4DQ08499 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PDE4DQ08499 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PDE4DQ08499 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PDE4DQ08499 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PDE4DQ08499 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PDE4DQ08499 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
PDE4DQ08499 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PDE4DQ08499 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PDE4DQ08499 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PDE4DQ08499 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PDE4DQ08499 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PDE4DQ08499 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PDE4DQ08499 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PDE4DQ08499 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PDE4DQ08499 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PDE4DQ08499 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
PDE4DQ08499 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PDE4DQ08499 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PDE4DQ08499 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PDE4DQ08499 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PDE4DQ08499 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms