Protein–RNA interactions for Protein: Q08289

CACNB2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB2Q08289 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CACNB2Q08289 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CACNB2Q08289 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CACNB2Q08289 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CACNB2Q08289 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CACNB2Q08289 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CACNB2Q08289 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CACNB2Q08289 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CACNB2Q08289 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
CACNB2Q08289 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CACNB2Q08289 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CACNB2Q08289 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CACNB2Q08289 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CACNB2Q08289 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CACNB2Q08289 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CACNB2Q08289 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CACNB2Q08289 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CACNB2Q08289 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CACNB2Q08289 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CACNB2Q08289 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CACNB2Q08289 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CACNB2Q08289 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CACNB2Q08289 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CACNB2Q08289 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
CACNB2Q08289 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CACNB2Q08289 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
CACNB2Q08289 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CACNB2Q08289 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CACNB2Q08289 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CACNB2Q08289 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CACNB2Q08289 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CACNB2Q08289 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CACNB2Q08289 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CACNB2Q08289 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CACNB2Q08289 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CACNB2Q08289 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CACNB2Q08289 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CACNB2Q08289 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CACNB2Q08289 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CACNB2Q08289 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CACNB2Q08289 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CACNB2Q08289 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CACNB2Q08289 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CACNB2Q08289 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CACNB2Q08289 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CACNB2Q08289 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CACNB2Q08289 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CACNB2Q08289 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CACNB2Q08289 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CACNB2Q08289 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CACNB2Q08289 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CACNB2Q08289 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CACNB2Q08289 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CACNB2Q08289 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CACNB2Q08289 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CACNB2Q08289 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CACNB2Q08289 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CACNB2Q08289 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CACNB2Q08289 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CACNB2Q08289 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CACNB2Q08289 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CACNB2Q08289 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CACNB2Q08289 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CACNB2Q08289 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CACNB2Q08289 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CACNB2Q08289 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
CACNB2Q08289 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CACNB2Q08289 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CACNB2Q08289 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CACNB2Q08289 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CACNB2Q08289 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CACNB2Q08289 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CACNB2Q08289 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CACNB2Q08289 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CACNB2Q08289 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CACNB2Q08289 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CACNB2Q08289 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CACNB2Q08289 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CACNB2Q08289 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CACNB2Q08289 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CACNB2Q08289 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CACNB2Q08289 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CACNB2Q08289 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CACNB2Q08289 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CACNB2Q08289 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CACNB2Q08289 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CACNB2Q08289 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CACNB2Q08289 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
CACNB2Q08289 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CACNB2Q08289 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CACNB2Q08289 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CACNB2Q08289 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CACNB2Q08289 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CACNB2Q08289 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CACNB2Q08289 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CACNB2Q08289 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CACNB2Q08289 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CACNB2Q08289 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CACNB2Q08289 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CACNB2Q08289 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms