Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GABPAQ06546 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GABPAQ06546 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GABPAQ06546 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GABPAQ06546 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
GABPAQ06546 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GABPAQ06546 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
GABPAQ06546 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
GABPAQ06546 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
GABPAQ06546 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
GABPAQ06546 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GABPAQ06546 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GABPAQ06546 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GABPAQ06546 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GABPAQ06546 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
GABPAQ06546 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GABPAQ06546 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
GABPAQ06546 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
GABPAQ06546 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GABPAQ06546 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
GABPAQ06546 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
GABPAQ06546 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
GABPAQ06546 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GABPAQ06546 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GABPAQ06546 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
GABPAQ06546 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
GABPAQ06546 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
GABPAQ06546 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GABPAQ06546 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GABPAQ06546 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GABPAQ06546 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GABPAQ06546 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GABPAQ06546 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GABPAQ06546 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GABPAQ06546 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GABPAQ06546 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GABPAQ06546 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GABPAQ06546 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GABPAQ06546 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GABPAQ06546 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GABPAQ06546 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GABPAQ06546 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GABPAQ06546 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GABPAQ06546 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GABPAQ06546 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GABPAQ06546 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GABPAQ06546 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GABPAQ06546 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
GABPAQ06546 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
GABPAQ06546 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
GABPAQ06546 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
GABPAQ06546 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GABPAQ06546 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GABPAQ06546 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GABPAQ06546 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GABPAQ06546 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
GABPAQ06546 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
GABPAQ06546 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
GABPAQ06546 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
GABPAQ06546 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
GABPAQ06546 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GABPAQ06546 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
GABPAQ06546 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GABPAQ06546 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
GABPAQ06546 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC27.26■■□□□ 1.95
GABPAQ06546 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GABPAQ06546 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
GABPAQ06546 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
GABPAQ06546 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
GABPAQ06546 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
GABPAQ06546 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GABPAQ06546 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GABPAQ06546 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
GABPAQ06546 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
GABPAQ06546 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GABPAQ06546 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GABPAQ06546 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
GABPAQ06546 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GABPAQ06546 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GABPAQ06546 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GABPAQ06546 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GABPAQ06546 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
GABPAQ06546 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
GABPAQ06546 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
GABPAQ06546 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
GABPAQ06546 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
GABPAQ06546 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GABPAQ06546 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GABPAQ06546 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GABPAQ06546 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
GABPAQ06546 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GABPAQ06546 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GABPAQ06546 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GABPAQ06546 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GABPAQ06546 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GABPAQ06546 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GABPAQ06546 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GABPAQ06546 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC27.22■■□□□ 1.95
GABPAQ06546 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
GABPAQ06546 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms