Protein–RNA interactions for Protein: Q06149

PDR8, Transcription factor PDR8, yeastyeast

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PDR8Q06149 ARN2YHL047C 1863 nt5.25□□□□□ -1.57
PDR8Q06149 NUD1YOR373W 2556 nt5.25□□□□□ -1.57
PDR8Q06149 CYK3YDL117W 2658 nt5.25□□□□□ -1.57
PDR8Q06149 VMA13YPR036W 1437 nt5.24□□□□□ -1.57
PDR8Q06149 DON1YDR273W 1098 nt5.24□□□□□ -1.57
PDR8Q06149 MTF1YMR228W 1026 nt5.24□□□□□ -1.57
PDR8Q06149 SCP1YOR367W 603 nt5.24□□□□□ -1.57
PDR8Q06149 RRT2YBR246W 1164 nt5.24□□□□□ -1.57
PDR8Q06149 SIP5YMR140W 1470 nt5.24□□□□□ -1.57
PDR8Q06149 DBF4YDR052C 2115 nt5.24□□□□□ -1.57
PDR8Q06149 HSX1tR(CCU)J 72 nt5.23□□□□□ -1.57
PDR8Q06149 XPT1YJR133W 630 nt5.23□□□□□ -1.57
PDR8Q06149 YLR283WYLR283W 945 nt5.23□□□□□ -1.57
PDR8Q06149 PGA3YML125C 939 nt5.23□□□□□ -1.57
PDR8Q06149 RAD17YOR368W 1206 nt5.23□□□□□ -1.57
PDR8Q06149 AFT1YGL071W 2073 nt5.23□□□□□ -1.57
PDR8Q06149 SHE10YGL228W 1734 nt5.23□□□□□ -1.57
PDR8Q06149 RPT2YDL007W 1314 nt5.23□□□□□ -1.57
PDR8Q06149 HSF1YGL073W 2502 nt5.22□□□□□ -1.57
PDR8Q06149 KCH1YJR054W 1494 nt5.22□□□□□ -1.57
PDR8Q06149 COX26YDR119W-A 201 nt5.22□□□□□ -1.57
PDR8Q06149 UPS3YDR185C 540 nt5.22□□□□□ -1.57
PDR8Q06149 RMD5YDR255C 1266 nt5.22□□□□□ -1.57
PDR8Q06149 MCM21YDR318W 1107 nt5.22□□□□□ -1.57
PDR8Q06149 YGL185CYGL185C 1140 nt5.22□□□□□ -1.57
PDR8Q06149 tN(GUU)CtN(GUU)C 74 nt5.22□□□□□ -1.57
PDR8Q06149 tN(GUU)FtN(GUU)F 74 nt5.22□□□□□ -1.57
PDR8Q06149 tN(GUU)GtN(GUU)G 74 nt5.22□□□□□ -1.57
PDR8Q06149 tN(GUU)KtN(GUU)K 74 nt5.22□□□□□ -1.57
PDR8Q06149 tN(GUU)LtN(GUU)L 74 nt5.22□□□□□ -1.57
PDR8Q06149 tN(GUU)N1tN(GUU)N1 74 nt5.22□□□□□ -1.57
PDR8Q06149 tN(GUU)N2tN(GUU)N2 74 nt5.22□□□□□ -1.57
PDR8Q06149 tN(GUU)O1tN(GUU)O1 74 nt5.22□□□□□ -1.57
PDR8Q06149 tN(GUU)O2tN(GUU)O2 74 nt5.22□□□□□ -1.57
PDR8Q06149 tN(GUU)PtN(GUU)P 74 nt5.22□□□□□ -1.57
PDR8Q06149 YNL019CYNL019C 855 nt5.22□□□□□ -1.57
PDR8Q06149 YNL033WYNL033W 855 nt5.22□□□□□ -1.57
PDR8Q06149 RHO2YNL090W 579 nt5.22□□□□□ -1.57
PDR8Q06149 RPC19YNL113W 429 nt5.22□□□□□ -1.57
PDR8Q06149 YOL024WYOL024W 519 nt5.22□□□□□ -1.57
PDR8Q06149 NPT1YOR209C 1290 nt5.22□□□□□ -1.57
PDR8Q06149 FRE3YOR381W 2136 nt5.22□□□□□ -1.57
PDR8Q06149 TEF1YPR080W 1377 nt5.21□□□□□ -1.58
PDR8Q06149 TEF2YBR118W 1377 nt5.21□□□□□ -1.58
PDR8Q06149 URA7YBL039C 1740 nt5.21□□□□□ -1.58
PDR8Q06149 YCR097W-AYCR097W-A 267 nt5.21□□□□□ -1.58
PDR8Q06149 URA3YEL021W 804 nt5.21□□□□□ -1.58
PDR8Q06149 MFA2YNL145W 117 nt5.21□□□□□ -1.58
PDR8Q06149 YOL050CYOL050C 321 nt5.21□□□□□ -1.58
PDR8Q06149 BRL1YHR036W 1416 nt5.21□□□□□ -1.58
PDR8Q06149 OCA5YHL029C 2040 nt5.21□□□□□ -1.58
PDR8Q06149 NFI1YOR156C 2181 nt5.21□□□□□ -1.58
PDR8Q06149 VHS1YDR247W 1386 nt5.2□□□□□ -1.58
PDR8Q06149 RHB1YCR027C 630 nt5.2□□□□□ -1.58
PDR8Q06149 EFM4YIL064W 774 nt5.2□□□□□ -1.58
PDR8Q06149 PRS1YKL181W 1284 nt5.2□□□□□ -1.58
PDR8Q06149 SED5YLR026C 1023 nt5.2□□□□□ -1.58
PDR8Q06149 TFS1YLR178C 660 nt5.2□□□□□ -1.58
PDR8Q06149 YLR402WYLR402W 192 nt5.2□□□□□ -1.58
PDR8Q06149 DAL82YNL314W 768 nt5.2□□□□□ -1.58
PDR8Q06149 YBR230W-AYBR230W-A 201 nt5.2□□□□□ -1.58
PDR8Q06149 UTP7YER082C 1665 nt5.2□□□□□ -1.58
PDR8Q06149 MIF2YKL089W 1650 nt5.2□□□□□ -1.58
PDR8Q06149 ADE13YLR359W 1449 nt5.2□□□□□ -1.58
PDR8Q06149 BAP2YBR068C 1830 nt5.2□□□□□ -1.58
PDR8Q06149 IMA1YGR287C 1770 nt5.19□□□□□ -1.58
PDR8Q06149 YLH47YPR125W 1365 nt5.19□□□□□ -1.58
PDR8Q06149 SOG2YOR353C 2376 nt5.19□□□□□ -1.58
PDR8Q06149 YDL241WYDL241W 372 nt5.19□□□□□ -1.58
PDR8Q06149 MAF1YDR005C 1188 nt5.19□□□□□ -1.58
PDR8Q06149 GIR2YDR152W 798 nt5.19□□□□□ -1.58
PDR8Q06149 GRX4YER174C 735 nt5.19□□□□□ -1.58
PDR8Q06149 SKI8YGL213C 1194 nt5.19□□□□□ -1.58
PDR8Q06149 YJR085CYJR085C 318 nt5.19□□□□□ -1.58
PDR8Q06149 PEX22YAL055W 543 nt5.19□□□□□ -1.58
PDR8Q06149 CKA2YOR061W 1020 nt5.19□□□□□ -1.58
PDR8Q06149 ECM33YBR078W 1290 nt5.19□□□□□ -1.58
PDR8Q06149 NRD1YNL251C 1728 nt5.19□□□□□ -1.58
PDR8Q06149 ACF2YLR144C 2340 nt5.19□□□□□ -1.58
PDR8Q06149 ACC1YNR016C 6702 nt5.19□□□□□ -1.58
PDR8Q06149 WTM2YOR229W 1404 nt5.18□□□□□ -1.58
PDR8Q06149 ADY2YCR010C 852 nt5.18□□□□□ -1.58
PDR8Q06149 YDL034WYDL034W 345 nt5.18□□□□□ -1.58
PDR8Q06149 CAD1YDR423C 1230 nt5.18□□□□□ -1.58
PDR8Q06149 DBP8YHR169W 1296 nt5.18□□□□□ -1.58
PDR8Q06149 PGU1YJR153W 1086 nt5.18□□□□□ -1.58
PDR8Q06149 YLL059CYLL059C 507 nt5.18□□□□□ -1.58
PDR8Q06149 RRP40YOL142W 723 nt5.18□□□□□ -1.58
PDR8Q06149 ATE1YGL017W 1512 nt5.18□□□□□ -1.58
PDR8Q06149 ARO9YHR137W 1542 nt5.18□□□□□ -1.58
PDR8Q06149 RTT106YNL206C 1368 nt5.17□□□□□ -1.58
PDR8Q06149 SEC39YLR440C 2130 nt5.17□□□□□ -1.58
PDR8Q06149 RPT1YKL145W 1404 nt5.17□□□□□ -1.58
PDR8Q06149 YDR541CYDR541C 1035 nt5.17□□□□□ -1.58
PDR8Q06149 YJR056CYJR056C 711 nt5.17□□□□□ -1.58
PDR8Q06149 UBA3YPR066W 900 nt5.17□□□□□ -1.58
PDR8Q06149 YPR098CYPR098C 486 nt5.17□□□□□ -1.58
PDR8Q06149 RSC30YHR056C 2652 nt5.17□□□□□ -1.58
PDR8Q06149 PSE1YMR308C 3270 nt5.16□□□□□ -1.58
PDR8Q06149 TUP1YCR084C 2142 nt5.16□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 14 ms