Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CALD1Q05682 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CALD1Q05682 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CALD1Q05682 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
CALD1Q05682 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CALD1Q05682 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
CALD1Q05682 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
CALD1Q05682 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CALD1Q05682 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
CALD1Q05682 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
CALD1Q05682 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CALD1Q05682 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
CALD1Q05682 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
CALD1Q05682 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
CALD1Q05682 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
CALD1Q05682 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
CALD1Q05682 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
CALD1Q05682 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
CALD1Q05682 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CALD1Q05682 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
CALD1Q05682 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
CALD1Q05682 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC30.11■■■□□ 2.41
CALD1Q05682 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
CALD1Q05682 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CALD1Q05682 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
CALD1Q05682 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CALD1Q05682 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CALD1Q05682 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
CALD1Q05682 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
CALD1Q05682 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CALD1Q05682 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CALD1Q05682 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CALD1Q05682 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC30.09■■■□□ 2.41
CALD1Q05682 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CALD1Q05682 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CALD1Q05682 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
CALD1Q05682 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
CALD1Q05682 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CALD1Q05682 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CALD1Q05682 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC30.09■■■□□ 2.41
CALD1Q05682 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CALD1Q05682 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CALD1Q05682 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CALD1Q05682 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CALD1Q05682 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CALD1Q05682 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CALD1Q05682 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CALD1Q05682 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CALD1Q05682 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CALD1Q05682 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.41
CALD1Q05682 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CALD1Q05682 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CALD1Q05682 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CALD1Q05682 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CALD1Q05682 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CALD1Q05682 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CALD1Q05682 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CALD1Q05682 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CALD1Q05682 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CALD1Q05682 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CALD1Q05682 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CALD1Q05682 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CALD1Q05682 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CALD1Q05682 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CALD1Q05682 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CALD1Q05682 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CALD1Q05682 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CALD1Q05682 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CALD1Q05682 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
CALD1Q05682 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CALD1Q05682 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CALD1Q05682 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CALD1Q05682 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
CALD1Q05682 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
CALD1Q05682 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
CALD1Q05682 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CALD1Q05682 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
CALD1Q05682 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CALD1Q05682 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CALD1Q05682 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CALD1Q05682 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CALD1Q05682 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CALD1Q05682 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CALD1Q05682 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CALD1Q05682 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CALD1Q05682 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CALD1Q05682 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
CALD1Q05682 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
CALD1Q05682 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CALD1Q05682 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CALD1Q05682 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CALD1Q05682 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
CALD1Q05682 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CALD1Q05682 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CALD1Q05682 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CALD1Q05682 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CALD1Q05682 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CALD1Q05682 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CALD1Q05682 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CALD1Q05682 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms