Protein–RNA interactions for Protein: Q05513

PRKCZ, Protein kinase C zeta type, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCZQ05513 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PRKCZQ05513 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PRKCZQ05513 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PRKCZQ05513 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PRKCZQ05513 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
PRKCZQ05513 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PRKCZQ05513 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PRKCZQ05513 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PRKCZQ05513 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PRKCZQ05513 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PRKCZQ05513 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PRKCZQ05513 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PRKCZQ05513 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PRKCZQ05513 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PRKCZQ05513 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PRKCZQ05513 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PRKCZQ05513 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PRKCZQ05513 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PRKCZQ05513 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PRKCZQ05513 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PRKCZQ05513 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PRKCZQ05513 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PRKCZQ05513 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PRKCZQ05513 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PRKCZQ05513 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PRKCZQ05513 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PRKCZQ05513 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PRKCZQ05513 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PRKCZQ05513 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PRKCZQ05513 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PRKCZQ05513 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PRKCZQ05513 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PRKCZQ05513 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PRKCZQ05513 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
PRKCZQ05513 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PRKCZQ05513 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PRKCZQ05513 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PRKCZQ05513 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PRKCZQ05513 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PRKCZQ05513 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PRKCZQ05513 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PRKCZQ05513 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PRKCZQ05513 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PRKCZQ05513 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PRKCZQ05513 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PRKCZQ05513 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PRKCZQ05513 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PRKCZQ05513 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PRKCZQ05513 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PRKCZQ05513 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PRKCZQ05513 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PRKCZQ05513 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PRKCZQ05513 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PRKCZQ05513 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PRKCZQ05513 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
PRKCZQ05513 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PRKCZQ05513 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
PRKCZQ05513 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.8
PRKCZQ05513 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PRKCZQ05513 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PRKCZQ05513 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PRKCZQ05513 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PRKCZQ05513 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
PRKCZQ05513 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PRKCZQ05513 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PRKCZQ05513 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PRKCZQ05513 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PRKCZQ05513 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PRKCZQ05513 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PRKCZQ05513 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PRKCZQ05513 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PRKCZQ05513 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PRKCZQ05513 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PRKCZQ05513 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
PRKCZQ05513 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PRKCZQ05513 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PRKCZQ05513 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PRKCZQ05513 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
PRKCZQ05513 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PRKCZQ05513 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PRKCZQ05513 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PRKCZQ05513 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
PRKCZQ05513 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PRKCZQ05513 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PRKCZQ05513 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PRKCZQ05513 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PRKCZQ05513 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
PRKCZQ05513 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PRKCZQ05513 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PRKCZQ05513 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PRKCZQ05513 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PRKCZQ05513 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PRKCZQ05513 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PRKCZQ05513 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PRKCZQ05513 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
PRKCZQ05513 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PRKCZQ05513 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PRKCZQ05513 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PRKCZQ05513 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
PRKCZQ05513 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms