Protein–RNA interactions for Protein: Q05215

EGR4, Early growth response protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 589 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR4Q05215 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
EGR4Q05215 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
EGR4Q05215 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
EGR4Q05215 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
EGR4Q05215 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
EGR4Q05215 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
EGR4Q05215 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
EGR4Q05215 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
EGR4Q05215 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
EGR4Q05215 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
EGR4Q05215 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
EGR4Q05215 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
EGR4Q05215 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
EGR4Q05215 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
EGR4Q05215 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
EGR4Q05215 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
EGR4Q05215 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
EGR4Q05215 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
EGR4Q05215 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
EGR4Q05215 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
EGR4Q05215 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
EGR4Q05215 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
EGR4Q05215 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
EGR4Q05215 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
EGR4Q05215 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
EGR4Q05215 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
EGR4Q05215 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
EGR4Q05215 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
EGR4Q05215 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
EGR4Q05215 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
EGR4Q05215 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
EGR4Q05215 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
EGR4Q05215 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
EGR4Q05215 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
EGR4Q05215 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
EGR4Q05215 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
EGR4Q05215 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
EGR4Q05215 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
EGR4Q05215 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
EGR4Q05215 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
EGR4Q05215 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
EGR4Q05215 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
EGR4Q05215 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
EGR4Q05215 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
EGR4Q05215 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
EGR4Q05215 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
EGR4Q05215 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
EGR4Q05215 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
EGR4Q05215 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
EGR4Q05215 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
EGR4Q05215 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
EGR4Q05215 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
EGR4Q05215 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
EGR4Q05215 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
EGR4Q05215 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
EGR4Q05215 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
EGR4Q05215 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
EGR4Q05215 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
EGR4Q05215 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
EGR4Q05215 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
EGR4Q05215 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
EGR4Q05215 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
EGR4Q05215 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
EGR4Q05215 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
EGR4Q05215 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
EGR4Q05215 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
EGR4Q05215 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
EGR4Q05215 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
EGR4Q05215 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
EGR4Q05215 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
EGR4Q05215 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
EGR4Q05215 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
EGR4Q05215 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
EGR4Q05215 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
EGR4Q05215 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
EGR4Q05215 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
EGR4Q05215 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
EGR4Q05215 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
EGR4Q05215 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
EGR4Q05215 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
EGR4Q05215 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
EGR4Q05215 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
EGR4Q05215 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
EGR4Q05215 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
EGR4Q05215 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
EGR4Q05215 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
EGR4Q05215 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
EGR4Q05215 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
EGR4Q05215 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
EGR4Q05215 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
EGR4Q05215 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
EGR4Q05215 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
EGR4Q05215 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
EGR4Q05215 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
EGR4Q05215 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
EGR4Q05215 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
EGR4Q05215 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
EGR4Q05215 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
EGR4Q05215 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
EGR4Q05215 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms