Protein–RNA interactions for Protein: Q04446

GBE1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBE1Q04446 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GBE1Q04446 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GBE1Q04446 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GBE1Q04446 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GBE1Q04446 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GBE1Q04446 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GBE1Q04446 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GBE1Q04446 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GBE1Q04446 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
GBE1Q04446 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GBE1Q04446 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GBE1Q04446 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GBE1Q04446 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GBE1Q04446 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GBE1Q04446 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GBE1Q04446 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GBE1Q04446 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GBE1Q04446 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GBE1Q04446 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GBE1Q04446 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GBE1Q04446 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
GBE1Q04446 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GBE1Q04446 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GBE1Q04446 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GBE1Q04446 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GBE1Q04446 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GBE1Q04446 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GBE1Q04446 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
GBE1Q04446 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GBE1Q04446 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GBE1Q04446 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GBE1Q04446 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GBE1Q04446 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GBE1Q04446 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GBE1Q04446 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GBE1Q04446 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GBE1Q04446 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GBE1Q04446 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GBE1Q04446 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GBE1Q04446 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GBE1Q04446 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
GBE1Q04446 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GBE1Q04446 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GBE1Q04446 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GBE1Q04446 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GBE1Q04446 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GBE1Q04446 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GBE1Q04446 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GBE1Q04446 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GBE1Q04446 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GBE1Q04446 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GBE1Q04446 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GBE1Q04446 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GBE1Q04446 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GBE1Q04446 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GBE1Q04446 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GBE1Q04446 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GBE1Q04446 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GBE1Q04446 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GBE1Q04446 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GBE1Q04446 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GBE1Q04446 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
GBE1Q04446 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GBE1Q04446 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GBE1Q04446 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GBE1Q04446 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GBE1Q04446 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GBE1Q04446 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GBE1Q04446 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GBE1Q04446 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GBE1Q04446 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GBE1Q04446 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
GBE1Q04446 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GBE1Q04446 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GBE1Q04446 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GBE1Q04446 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GBE1Q04446 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GBE1Q04446 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GBE1Q04446 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GBE1Q04446 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GBE1Q04446 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GBE1Q04446 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GBE1Q04446 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GBE1Q04446 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
GBE1Q04446 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GBE1Q04446 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GBE1Q04446 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
GBE1Q04446 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
GBE1Q04446 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GBE1Q04446 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GBE1Q04446 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GBE1Q04446 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GBE1Q04446 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GBE1Q04446 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GBE1Q04446 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GBE1Q04446 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
GBE1Q04446 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GBE1Q04446 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GBE1Q04446 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GBE1Q04446 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms