Protein–RNA interactions for Protein: Q03702

CCE1, Cruciform cutting endonuclease 1, mitochondrial, yeastyeast

Predictions only

Length 353 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CCE1Q03702 TUB2YFL037W 1374 nt4.96□□□□□ -1.62
CCE1Q03702 ECM3YOR092W 1842 nt4.96□□□□□ -1.62
CCE1Q03702 RSA3YLR221C 663 nt4.96□□□□□ -1.62
CCE1Q03702 RPN5YDL147W 1338 nt4.96□□□□□ -1.62
CCE1Q03702 ZUO1YGR285C 1302 nt4.96□□□□□ -1.62
CCE1Q03702 YIL092WYIL092W 1902 nt4.95□□□□□ -1.62
CCE1Q03702 YEF1YEL041W 1488 nt4.95□□□□□ -1.62
CCE1Q03702 OXP1YKL215C 3861 nt4.95□□□□□ -1.62
CCE1Q03702 RRP45YDR280W 918 nt4.95□□□□□ -1.62
CCE1Q03702 MTW1YAL034W-A 870 nt4.95□□□□□ -1.62
CCE1Q03702 APN1YKL114C 1104 nt4.95□□□□□ -1.62
CCE1Q03702 YKR073CYKR073C 321 nt4.95□□□□□ -1.62
CCE1Q03702 DOM34YNL001W 1161 nt4.95□□□□□ -1.62
CCE1Q03702 AST1YBL069W 1290 nt4.95□□□□□ -1.62
CCE1Q03702 RFA2YNL312W 822 nt4.95□□□□□ -1.62
CCE1Q03702 MED4YOR174W 855 nt4.95□□□□□ -1.62
CCE1Q03702 MSH1YHR120W 2880 nt4.94□□□□□ -1.62
CCE1Q03702 YDR053WYDR053W 396 nt4.94□□□□□ -1.62
CCE1Q03702 RML2YEL050C 1182 nt4.94□□□□□ -1.62
CCE1Q03702 RPN12YFR052W 825 nt4.94□□□□□ -1.62
CCE1Q03702 ARO2YGL148W 1131 nt4.94□□□□□ -1.62
CCE1Q03702 PUS6YGR169C 1215 nt4.94□□□□□ -1.62
CCE1Q03702 KRE9YJL174W 831 nt4.94□□□□□ -1.62
CCE1Q03702 FUN19YAL034C 1242 nt4.94□□□□□ -1.62
CCE1Q03702 YKL223WYKL223W 333 nt4.94□□□□□ -1.62
CCE1Q03702 MRPL4YLR439W 960 nt4.94□□□□□ -1.62
CCE1Q03702 SCW10YMR305C 1170 nt4.94□□□□□ -1.62
CCE1Q03702 HEM15YOR176W 1182 nt4.94□□□□□ -1.62
CCE1Q03702 SUE1YPR151C 621 nt4.94□□□□□ -1.62
CCE1Q03702 RIM101YHL027W 1878 nt4.94□□□□□ -1.62
CCE1Q03702 YGR291CYGR291C 222 nt4.93□□□□□ -1.62
CCE1Q03702 ARP1YHR129C 1155 nt4.93□□□□□ -1.62
CCE1Q03702 RFA1YAR007C 1866 nt4.93□□□□□ -1.62
CCE1Q03702 MRPL24YMR193W 777 nt4.93□□□□□ -1.62
CCE1Q03702 YNL296WYNL296W 315 nt4.93□□□□□ -1.62
CCE1Q03702 RPL21BYPL079W 483 nt4.93□□□□□ -1.62
CCE1Q03702 APM1YPL259C 1428 nt4.93□□□□□ -1.62
CCE1Q03702 YBR298C-AYBR298C-A 222 nt4.93□□□□□ -1.62
CCE1Q03702 NSG1YHR133C 876 nt4.92□□□□□ -1.62
CCE1Q03702 RPB4YJL140W 666 nt4.92□□□□□ -1.62
CCE1Q03702 ENV9YOR246C 993 nt4.92□□□□□ -1.62
CCE1Q03702 YPR150WYPR150W 522 nt4.92□□□□□ -1.62
CCE1Q03702 PUS1YPL212C 1635 nt4.92□□□□□ -1.62
CCE1Q03702 RBA50YDR527W 1320 nt4.92□□□□□ -1.62
CCE1Q03702 YEL077CYEL077C 3834 nt4.92□□□□□ -1.62
CCE1Q03702 THP1YOL072W 1368 nt4.91□□□□□ -1.62
CCE1Q03702 SRG1SRG1 551 nt4.91□□□□□ -1.62
CCE1Q03702 MRF1YGL143C 1242 nt4.91□□□□□ -1.62
CCE1Q03702 VPS29YHR012W 849 nt4.91□□□□□ -1.62
CCE1Q03702 NIT2YJL126W 924 nt4.91□□□□□ -1.62
CCE1Q03702 SEC17YBL050W 879 nt4.91□□□□□ -1.62
CCE1Q03702 SFT2YBL102W 648 nt4.91□□□□□ -1.62
CCE1Q03702 HMT1YBR034C 1047 nt4.91□□□□□ -1.62
CCE1Q03702 VHS1YDR247W 1386 nt4.91□□□□□ -1.62
CCE1Q03702 RTT103YDR289C 1230 nt4.9□□□□□ -1.63
CCE1Q03702 MF(ALPHA)2YGL089C 363 nt4.9□□□□□ -1.63
CCE1Q03702 YJL107CYJL107C 1164 nt4.9□□□□□ -1.63
CCE1Q03702 XPT1YJR133W 630 nt4.9□□□□□ -1.63
CCE1Q03702 ISU2YOR226C 471 nt4.9□□□□□ -1.63
CCE1Q03702 RET1YOR207C 3450 nt4.9□□□□□ -1.63
CCE1Q03702 DIT1YDR403W 1611 nt4.9□□□□□ -1.63
CCE1Q03702 RRN3YKL125W 1884 nt4.9□□□□□ -1.63
CCE1Q03702 MET7YOR241W 1647 nt4.9□□□□□ -1.63
CCE1Q03702 MNN10YDR245W 1182 nt4.89□□□□□ -1.63
CCE1Q03702 SPL2YHR136C 447 nt4.89□□□□□ -1.63
CCE1Q03702 tX(XXX)DtX(XXX)D 100 nt4.89□□□□□ -1.63
CCE1Q03702 MRS3YJL133W 945 nt4.89□□□□□ -1.63
CCE1Q03702 YJL193WYJL193W 1209 nt4.89□□□□□ -1.63
CCE1Q03702 SRN2YLR119W 642 nt4.89□□□□□ -1.63
CCE1Q03702 CTR3YLR411W 726 nt4.89□□□□□ -1.63
CCE1Q03702 PRE2YPR103W 864 nt4.89□□□□□ -1.63
CCE1Q03702 ABZ1YNR033W 2364 nt4.89□□□□□ -1.63
CCE1Q03702 MKC7YDR144C 1791 nt4.88□□□□□ -1.63
CCE1Q03702 SYG1YIL047C 2709 nt4.88□□□□□ -1.63
CCE1Q03702 HMLALPHA1YCL066W 528 nt4.88□□□□□ -1.63
CCE1Q03702 MATALPHA1YCR040W 528 nt4.88□□□□□ -1.63
CCE1Q03702 SEH1YGL100W 1050 nt4.88□□□□□ -1.63
CCE1Q03702 RRT7YLL030C 342 nt4.88□□□□□ -1.63
CCE1Q03702 YMR010WYMR010W 1218 nt4.88□□□□□ -1.63
CCE1Q03702 PHA2YNL316C 1005 nt4.88□□□□□ -1.63
CCE1Q03702 SCP1YOR367W 603 nt4.88□□□□□ -1.63
CCE1Q03702 COA2YPL189C-A 207 nt4.88□□□□□ -1.63
CCE1Q03702 ALG5YPL227C 1005 nt4.88□□□□□ -1.63
CCE1Q03702 NUP116YMR047C 3342 nt4.88□□□□□ -1.63
CCE1Q03702 FUI1YBL042C 1920 nt4.87□□□□□ -1.63
CCE1Q03702 FHL1YPR104C 2811 nt4.87□□□□□ -1.63
CCE1Q03702 BGL2YGR282C 942 nt4.87□□□□□ -1.63
CCE1Q03702 CTR2YHR175W 570 nt4.87□□□□□ -1.63
CCE1Q03702 YIR043CYIR043C 693 nt4.87□□□□□ -1.63
CCE1Q03702 PHO86YJL117W 936 nt4.87□□□□□ -1.63
CCE1Q03702 PEX22YAL055W 543 nt4.87□□□□□ -1.63
CCE1Q03702 YAL056C-AYAL056C-A 351 nt4.87□□□□□ -1.63
CCE1Q03702 YLR296WYLR296W 327 nt4.87□□□□□ -1.63
CCE1Q03702 YNR042WYNR042W 429 nt4.87□□□□□ -1.63
CCE1Q03702 RPL3YOR063W 1164 nt4.87□□□□□ -1.63
CCE1Q03702 JEM1YJL073W 1938 nt4.87□□□□□ -1.63
CCE1Q03702 CTS2YDR371W 1536 nt4.87□□□□□ -1.63
CCE1Q03702 YBR138CYBR138C 1575 nt4.87□□□□□ -1.63
CCE1Q03702 YNL095CYNL095C 1929 nt4.86□□□□□ -1.63
CCE1Q03702 JAC1YGL018C 555 nt4.86□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 11.3 ms