Protein–RNA interactions for Protein: Q03518

TAP1, Antigen peptide transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 808 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAP1Q03518 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TAP1Q03518 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TAP1Q03518 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TAP1Q03518 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TAP1Q03518 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
TAP1Q03518 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
TAP1Q03518 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TAP1Q03518 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TAP1Q03518 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TAP1Q03518 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TAP1Q03518 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TAP1Q03518 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TAP1Q03518 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TAP1Q03518 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
TAP1Q03518 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TAP1Q03518 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
TAP1Q03518 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TAP1Q03518 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
TAP1Q03518 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TAP1Q03518 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TAP1Q03518 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TAP1Q03518 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TAP1Q03518 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TAP1Q03518 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TAP1Q03518 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TAP1Q03518 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TAP1Q03518 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TAP1Q03518 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TAP1Q03518 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TAP1Q03518 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TAP1Q03518 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TAP1Q03518 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TAP1Q03518 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TAP1Q03518 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TAP1Q03518 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
TAP1Q03518 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TAP1Q03518 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TAP1Q03518 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TAP1Q03518 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TAP1Q03518 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TAP1Q03518 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TAP1Q03518 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TAP1Q03518 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
TAP1Q03518 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
TAP1Q03518 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TAP1Q03518 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TAP1Q03518 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TAP1Q03518 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TAP1Q03518 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TAP1Q03518 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TAP1Q03518 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TAP1Q03518 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TAP1Q03518 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TAP1Q03518 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
TAP1Q03518 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
TAP1Q03518 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TAP1Q03518 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TAP1Q03518 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TAP1Q03518 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TAP1Q03518 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TAP1Q03518 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TAP1Q03518 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TAP1Q03518 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TAP1Q03518 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TAP1Q03518 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
TAP1Q03518 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TAP1Q03518 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TAP1Q03518 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TAP1Q03518 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TAP1Q03518 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TAP1Q03518 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
TAP1Q03518 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TAP1Q03518 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TAP1Q03518 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TAP1Q03518 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TAP1Q03518 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TAP1Q03518 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
TAP1Q03518 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TAP1Q03518 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TAP1Q03518 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TAP1Q03518 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TAP1Q03518 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TAP1Q03518 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TAP1Q03518 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TAP1Q03518 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TAP1Q03518 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TAP1Q03518 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TAP1Q03518 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TAP1Q03518 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TAP1Q03518 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TAP1Q03518 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
TAP1Q03518 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TAP1Q03518 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TAP1Q03518 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TAP1Q03518 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TAP1Q03518 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TAP1Q03518 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TAP1Q03518 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TAP1Q03518 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TAP1Q03518 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.6 ms